A curated catalogue of human genomic structural variation

Variant Details

Variant: nsv607781

Internal ID

16395190

Landmark

Location Information

Type	Coordinates	Assembly	Other Links
Inner	chr7:90181390..90182984	hg38	UCSC Ensembl
Inner	chr7:89810704..89812298	hg19	UCSC Ensembl
Inner	chr7:89648640..89650234	hg18	UCSC Ensembl

Cytoband

7q21.13

Allele length

Assembly	Allele length
hg38	1595
hg19	1595
hg18	1595

Variant Type

CNV loss

Copy Number

Allele State

Allele Origin

Probe Count

Validation Flag

Merged Status

M

Merged Variants

Supporting Variants

nssv1089698, nssv1090048, nssv1089645, nssv1089872, nssv1089975, nssv1090022, nssv1089998, nssv1089904, nssv1089963, nssv1089677, nssv1089999, nssv1090096, nssv1090014, nssv1090049, nssv1089857, nssv1089591, nssv1089922, nssv1089908, nssv1089945, nssv1090087, nssv1089774, nssv1089892, nssv1089619, nssv1089981, nssv1089875, nssv1090074, nssv1089853, nssv1090011, nssv1089752, nssv1090006, nssv1089992, nssv1090067, nssv1089917, nssv1089959, nssv1089623, nssv1089804, nssv1090043, nssv1089606, nssv1089941, nssv1090064, nssv1089822, nssv1089741, nssv1090009, nssv1090068, nssv1089718, nssv1089604, nssv1089885, nssv1089920, nssv1089966, nssv1089826, nssv1090072, nssv1089890, nssv1089616, nssv1090045, nssv1089769, nssv1089743, nssv1089688, nssv1089812, nssv1090070, nssv1089593, nssv1089985, nssv1089928, nssv1089756, nssv1089584, nssv1090042, nssv1089713, nssv1089580, nssv1089767, nssv1089736, nssv1089723, nssv1089871, nssv1089924, nssv1089612, nssv1089996, nssv1089970, nssv1089997, nssv1089598, nssv1089745, nssv1089972, nssv1089983, nssv1089842, nssv1089909, nssv1089866, nssv1089776, nssv1089978, nssv1089672, nssv1089787, nssv1089955, nssv1089594, nssv1089967, nssv1089682, nssv1090092, nssv1089611, nssv1090053, nssv1089962, nssv1089867, nssv1089653, nssv1089731, nssv1089911, nssv1089870, nssv1090103, nssv1090000, nssv1089896, nssv1089889, nssv1089883, nssv1089887, nssv1089749, nssv1089794, nssv1089800, nssv1089990, nssv1089814, nssv1090038, nssv1089851, nssv1089818, nssv1089750, nssv1089862, nssv1090102, nssv1090101, nssv1089940, nssv1089585, nssv1089856, nssv1089789, nssv1089592, nssv1089605, nssv1089719, nssv1089912, nssv1090095, nssv1090010, nssv1089705, nssv1089689, nssv1089854, nssv1089728, nssv1089921, nssv1089795, nssv1089817, nssv1090020, nssv1089801, nssv1090055, nssv1089980, nssv1089639, nssv1089898, nssv1089877, nssv1089709, nssv1089797, nssv1089662, nssv1089587, nssv1089670, nssv1089618, nssv1089907, nssv1089764, nssv1090015, nssv1089824, nssv1089668, nssv1090093, nssv1089759, nssv1089597, nssv1089881, nssv1089674, nssv1089775, nssv1089708, nssv1089935, nssv1089873, nssv1089582, nssv1089914, nssv1089596, nssv1090079, nssv1089697, nssv1089655, nssv1090033, nssv1089678, nssv1089716, nssv1090004, nssv1089711, nssv1089581, nssv1089821, nssv1089943, nssv1089918, nssv1089846, nssv1089984, nssv1089946, nssv1089636, nssv1089633, nssv1089715, nssv1089673, nssv1089942, nssv1089840, nssv1090105, nssv1089757, nssv1089954, nssv1089848, nssv1089845, nssv1089758, nssv1089964, nssv1089982, nssv1089903, nssv1089701, nssv1089869, nssv1089699, nssv1090016, nssv1089879, nssv1089635, nssv1089755, nssv1089820, nssv1089649, nssv1090081, nssv1089643, nssv1090080, nssv1090063, nssv1089647, nssv1089838, nssv1089796, nssv1089936, nssv1089977, nssv1089808, nssv1090059, nssv1090007, nssv1089744, nssv1089831, nssv1089961, nssv1089900, nssv1089706, nssv1089994, nssv1089765, nssv1089952, nssv1089691, nssv1089650, nssv1089656, nssv1089905, nssv1090106, nssv1090082, nssv1089679, nssv1089832, nssv1089902, nssv1089613, nssv1089614, nssv1090071, nssv1089913, nssv1089676, nssv1089700, nssv1089958, nssv1089886, nssv1089988, nssv1089729, nssv1089893, nssv1089971, nssv1089785, nssv1090088, nssv1089894, nssv1090078, nssv1089702, nssv1089897, nssv1090086, nssv1089595, nssv1089600, nssv1090001, nssv1090062, nssv1089858, nssv1090008, nssv1090058, nssv1089828, nssv1089807, nssv1089802, nssv1089947, nssv1090041, nssv1090002, nssv1089778, nssv1089693, nssv1089888, nssv1090097, nssv1089601, nssv1090031, nssv1089625, nssv1090050, nssv1089927, nssv1089836, nssv1089830, nssv1089608, nssv1090021, nssv1089627, nssv1089933, nssv1089628, nssv1089621, nssv1090089, nssv1090036, nssv1089732, nssv1089620, nssv1089610, nssv1089938, nssv1089948, nssv1089634, nssv1089632, nssv1089622, nssv1089829, nssv1089843, nssv1089768, nssv1089792, nssv1090017, nssv1089993, nssv1089944, nssv1089850, nssv1089722, nssv1089629, nssv1090100, nssv1089696, nssv1089864, nssv1089906, nssv1089825, nssv1089733, nssv1089839, nssv1090027, nssv1089738, nssv1090051, nssv1089707, nssv1090091, nssv1089951, nssv1089899, nssv1090083, nssv1089740, nssv1090034, nssv1089813, nssv1089724, nssv1089640, nssv1089695, nssv1089648, nssv1089803, nssv1089784, nssv1090099, nssv1090037, nssv1089660, nssv1089953, nssv1089901, nssv1089878, nssv1089726, nssv1089974, nssv1089751, nssv1089630, nssv1090040, nssv1090061, nssv1089665, nssv1089762, nssv1089739, nssv1089799, nssv1090025, nssv1089766, nssv1089644, nssv1089915, nssv1090013, nssv1089956, nssv1089602, nssv1089782, nssv1090028, nssv1090054, nssv1089721, nssv1089609, nssv1090018, nssv1089891, nssv1089965, nssv1089748, nssv1090060, nssv1089638, nssv1089939, nssv1089680, nssv1089874, nssv1089779, nssv1089798, nssv1089742, nssv1089664, nssv1089770, nssv1090075, nssv1089930, nssv1089868, nssv1089763, nssv1089684, nssv1089876, nssv1089780, nssv1089735, nssv1089617, nssv1090056, nssv1089833, nssv1089837, nssv1089714, nssv1089773, nssv1089937, nssv1089579, nssv1089790, nssv1089669, nssv1089583, nssv1090104, nssv1089717, nssv1090090, nssv1090023, nssv1089844, nssv1089791, nssv1089841, nssv1089863, nssv1089637, nssv1089934, nssv1089793, nssv1090046, nssv1089667, nssv1090032, nssv1089652, nssv1089976, nssv1089737, nssv1089931, nssv1089861, nssv1089690, nssv1089957, nssv1089835, nssv1090026, nssv1090076, nssv1090098, nssv1089666, nssv1089809, nssv1089586, nssv1089615, nssv1089589, nssv1089659, nssv1089746, nssv1090024, nssv1089661, nssv1089771, nssv1089811, nssv1089588, nssv1089986, nssv1089968, nssv1089882, nssv1089607, nssv1089979, nssv1089761, nssv1089827, nssv1089675, nssv1089704, nssv1089753, nssv1090030, nssv1089663, nssv1090029, nssv1089919, nssv1089624, nssv1089658, nssv1089725, nssv1089646, nssv1090039, nssv1089641, nssv1089694, nssv1089730, nssv1090044, nssv1090057, nssv1090077, nssv1090012, nssv1089710, nssv1089654, nssv1089849, nssv1089847, nssv1089819, nssv1089727, nssv1089657, nssv1089686, nssv1089685, nssv1089960, nssv1089925, nssv1089865, nssv1089734, nssv1090094, nssv1089852, nssv1089683, nssv1089860, nssv1089995, nssv1089895, nssv1089987, nssv1089760, nssv1090065, nssv1089626, nssv1089815, nssv1089631, nssv1089703, nssv1089720, nssv1089884, nssv1089910, nssv1090003, nssv1089989, nssv1089834, nssv1089777, nssv1089788, nssv1089642, nssv1089590, nssv1089816, nssv1089599, nssv1089855, nssv1090019, nssv1089783, nssv1089916, nssv1089969, nssv1089923, nssv1090047, nssv1089859, nssv1090066, nssv1089929, nssv1090069, nssv1090085, nssv1090084, nssv1089926, nssv1089681, nssv1090035, nssv1089671, nssv1090005, nssv1089950, nssv1089712, nssv1089880, nssv1089781, nssv1089754, nssv1089810, nssv1089806, nssv1089687, nssv1089949, nssv1089991, nssv1089823, nssv1089932, nssv1090052, nssv1089603, nssv1089805, nssv1089973, nssv1089772, nssv1089786, nssv1089747, nssv1089651, nssv1089692, nssv1090073

Samples

Known Genes

Method

SNP array

Analysis

Illumina SNP array copy number analysis

Platform

Not reported

Comments

Reference

Cooper_et_al_2011

Pubmed ID

Accession Number(s)

Frequency

Sample Size	17421
Observed Gain	0
Observed Loss	528
Observed Complex	0
Frequency	n/a