A curated catalogue of human genomic structural variation

Variant Details

Variant: nsv599329

Internal ID

16386738

Landmark

Location Information

Type	Coordinates	Assembly	Other Links
Inner	chr5:106989206..106990598	hg38	UCSC Ensembl
Inner	chr5:106324907..106326299	hg19	UCSC Ensembl
Inner	chr5:106352806..106354198	hg18	UCSC Ensembl

Cytoband

5q21.3

Allele length

Assembly	Allele length
hg38	1393
hg19	1393
hg18	1393

Variant Type

CNV loss

Copy Number

Allele State

Allele Origin

Probe Count

Validation Flag

Merged Status

M

Merged Variants

Supporting Variants

nssv1040016, nssv1040152, nssv1040136, nssv1039941, nssv1040213, nssv1040193, nssv1040154, nssv1039919, nssv1040118, nssv1040025, nssv1040093, nssv1040036, nssv1039892, nssv1039855, nssv1040158, nssv1040129, nssv1039879, nssv1040188, nssv1039998, nssv1039935, nssv1039869, nssv1039837, nssv1039984, nssv1040195, nssv1039976, nssv1040189, nssv1040167, nssv1040017, nssv1040081, nssv1039948, nssv1040131, nssv1040122, nssv1040058, nssv1039893, nssv1040098, nssv1040125, nssv1039839, nssv1040014, nssv1040157, nssv1040104, nssv1040003, nssv1039940, nssv1039889, nssv1040215, nssv1039990, nssv1039912, nssv1040060, nssv1039983, nssv1039891, nssv1040006, nssv1039882, nssv1040043, nssv1039950, nssv1040183, nssv1039838, nssv1040007, nssv1040033, nssv1039999, nssv1040001, nssv1039904, nssv1039894, nssv1040115, nssv1040015, nssv1040087, nssv1040143, nssv1039961, nssv1040091, nssv1039931, nssv1039856, nssv1040144, nssv1039851, nssv1040169, nssv1039925, nssv1039916, nssv1040055, nssv1039963, nssv1039946, nssv1039852, nssv1039922, nssv1040023, nssv1040101, nssv1039964, nssv1040020, nssv1040127, nssv1039968, nssv1040123, nssv1039850, nssv1040199, nssv1040150, nssv1040126, nssv1040181, nssv1040133, nssv1040140, nssv1039844, nssv1040047, nssv1040108, nssv1040092, nssv1040184, nssv1039895, nssv1040022, nssv1040100, nssv1039989, nssv1039917, nssv1039866, nssv1040203, nssv1039996, nssv1039908, nssv1040210, nssv1040173, nssv1039853, nssv1040066, nssv1040019, nssv1039945, nssv1040008, nssv1040142, nssv1040139, nssv1040171, nssv1039985, nssv1039938, nssv1039974, nssv1040148, nssv1039885, nssv1040012, nssv1039975, nssv1040165, nssv1040107, nssv1040164, nssv1040039, nssv1039972, nssv1039969, nssv1039864, nssv1039987, nssv1040170, nssv1040078, nssv1039960, nssv1039841, nssv1039936, nssv1040117, nssv1040064, nssv1040040, nssv1039861, nssv1039858, nssv1040153, nssv1040180, nssv1040124, nssv1039973, nssv1040062, nssv1040175, nssv1039911, nssv1039927, nssv1039873, nssv1040149, nssv1040120, nssv1040054, nssv1039997, nssv1039971, nssv1040161, nssv1039933, nssv1040114, nssv1039965, nssv1040045, nssv1040029, nssv1040204, nssv1040137, nssv1039899, nssv1039878, nssv1040156, nssv1040190, nssv1040187, nssv1039842, nssv1040070, nssv1040049, nssv1039854, nssv1040179, nssv1039920, nssv1039870, nssv1039847, nssv1039979, nssv1039896, nssv1040044, nssv1039937, nssv1040063, nssv1040135, nssv1040138, nssv1040205, nssv1040162, nssv1040178, nssv1040202, nssv1040111, nssv1040051, nssv1040103, nssv1040090, nssv1040212, nssv1040176, nssv1040113, nssv1040097, nssv1039862, nssv1039957, nssv1039939, nssv1039860, nssv1040211, nssv1040011, nssv1040005, nssv1040155, nssv1039883, nssv1039913, nssv1039887, nssv1039981, nssv1040057, nssv1039903, nssv1040083, nssv1039918, nssv1039867, nssv1039863, nssv1040088, nssv1040035, nssv1040026, nssv1039881, nssv1040182, nssv1040214, nssv1040013, nssv1039923, nssv1039909, nssv1039962, nssv1039951, nssv1040034, nssv1040002, nssv1040206, nssv1040166, nssv1040084, nssv1040163, nssv1039915, nssv1040196, nssv1040068, nssv1039954, nssv1040021, nssv1040052, nssv1039865, nssv1039953, nssv1039944, nssv1040094, nssv1039868, nssv1040038, nssv1039859, nssv1039846, nssv1039955, nssv1040110, nssv1040027, nssv1040197, nssv1039947, nssv1040082, nssv1039898, nssv1040067, nssv1040065, nssv1040009, nssv1039914, nssv1039897, nssv1039857, nssv1040042, nssv1040024, nssv1039967, nssv1040030, nssv1040089, nssv1039992, nssv1039959, nssv1040072, nssv1040132, nssv1040056, nssv1040074, nssv1039890, nssv1040116, nssv1040121, nssv1040207, nssv1040134, nssv1040185, nssv1040077, nssv1039875, nssv1040106, nssv1040102, nssv1040079, nssv1040099, nssv1040174, nssv1040145, nssv1039880, nssv1039924, nssv1039994, nssv1040050, nssv1039901, nssv1040059, nssv1039921, nssv1040073, nssv1039884, nssv1040191, nssv1039956, nssv1040109, nssv1040112, nssv1039872, nssv1040037, nssv1040198, nssv1039986, nssv1040095, nssv1039978, nssv1039980, nssv1039849, nssv1040000, nssv1039877, nssv1039906, nssv1040046, nssv1039930, nssv1040069, nssv1039910, nssv1039848, nssv1039993, nssv1039942, nssv1040032, nssv1040086, nssv1039958, nssv1039929, nssv1039876, nssv1040146, nssv1039995, nssv1040004, nssv1040048, nssv1039949, nssv1039988, nssv1040128, nssv1040085, nssv1039977, nssv1039966, nssv1040075, nssv1040071, nssv1040010, nssv1039952, nssv1039932, nssv1040172, nssv1040151, nssv1040130, nssv1040192, nssv1039888, nssv1040160, nssv1039970, nssv1039902, nssv1040168, nssv1040080, nssv1040028, nssv1040209, nssv1039840, nssv1040053, nssv1039928, nssv1039926, nssv1039874, nssv1040200, nssv1040194, nssv1040186, nssv1040096, nssv1039845, nssv1040041, nssv1040018, nssv1039871, nssv1040201, nssv1039900, nssv1040159, nssv1039934, nssv1040031, nssv1040076, nssv1040147, nssv1039991, nssv1040177, nssv1039905, nssv1039886, nssv1040105, nssv1040141, nssv1039907, nssv1040208, nssv1039943, nssv1040061, nssv1039982, nssv1039843, nssv1040119

Samples

Known Genes

Method

SNP array

Analysis

Illumina SNP array copy number analysis

Platform

Not reported

Comments

Reference

Cooper_et_al_2011

Pubmed ID

Accession Number(s)

Frequency

Sample Size	17421
Observed Gain	0
Observed Loss	379
Observed Complex	0
Frequency	n/a