Variant DetailsVariant: nsv554897 | Internal ID | 15995620 | | Landmark | | | Location Information | | | Cytoband | 11q11 | | Allele length | | Assembly | Allele length | | hg38 | 76407 | | hg19 | 76407 | | hg18 | 76407 |
| | Variant Type | CNV gain+loss | | Copy Number | | | Allele State | | | Allele Origin | | | Probe Count | | | Validation Flag | | | Merged Status | M | | Merged Variants | dgv1915n54 | | Supporting Variants | nssv776248, nssv1175505, nssv1175199, nssv776358, nssv1175234, nssv776086, nssv1175605, nssv776168, nssv1175263, nssv1175231, nssv1175271, nssv776162, nssv1175683, nssv1175607, nssv776154, nssv1175562, nssv1174391, nssv1175543, nssv1174364, nssv1175278, nssv1175250, nssv1175329, nssv1175252, nssv1175322, nssv1175640, nssv776115, nssv1175694, nssv776363, nssv776149, nssv1175541, nssv1175540, nssv1175209, nssv776080, nssv776068, nssv1175704, nssv1175626, nssv1174432, nssv776102, nssv1175258, nssv1175558, nssv776065, nssv1174392, nssv1175654, nssv1174421, nssv1174374, nssv1175677, nssv776292, nssv776106, nssv1175530, nssv1174423, nssv776244, nssv1174328, nssv776053, nssv1175643, nssv776063, nssv776379, nssv776269, nssv1175675, nssv1175320, nssv1175236, nssv1175317, nssv1174434, nssv1174362, nssv776134, nssv1175245, nssv1174363, nssv1174335, nssv1174431, nssv776247, nssv776259, nssv776058, nssv776351, nssv1175313, nssv1175211, nssv776372, nssv1175647, nssv776087, nssv1175661, nssv1175635, nssv1175538, nssv776320, nssv1175287, nssv1174433, nssv1175510, nssv1175496, nssv776153, nssv776033, nssv776231, nssv776069, nssv776048, nssv1175202, nssv776226, nssv1175312, nssv776227, nssv1174353, nssv1174351, nssv776122, nssv776315, nssv1174368, nssv1175275, nssv776308, nssv776132, nssv1175525, nssv1175253, nssv776339, nssv776327, nssv776210, nssv1175518, nssv776157, nssv1175207, nssv776355, nssv1174309, nssv776107, nssv1175255, nssv776145, nssv1175601, nssv776345, nssv776174, nssv776278, nssv1174342, nssv1175702, nssv1175266, nssv776282, nssv1175686, nssv776142, nssv776342, nssv1175679, nssv776297, nssv776215, nssv1174410, nssv1175309, nssv1175274, nssv776198, nssv1175705, nssv1174327, nssv776305, nssv1175247, nssv1174333, nssv776324, nssv1174422, nssv776035, nssv776085, nssv1175300, nssv776185, nssv1174419, nssv776097, nssv1175703, nssv776140, nssv776099, nssv776331, nssv776286, nssv776059, nssv1175670, nssv776158, nssv1175657, nssv1174404, nssv776088, nssv1175488, nssv1174384, nssv1174325, nssv776109, nssv1175291, nssv1175623, nssv1175581, nssv776040, nssv776359, nssv1175249, nssv776374, nssv776135, nssv776366, nssv1174336, nssv776117, nssv1175557, nssv1174330, nssv776039, nssv1175293, nssv776349, nssv776228, nssv1175326, nssv1174425, nssv1174329, nssv1175692, nssv1174401, nssv776218, nssv1175331, nssv1175707, nssv1174430, nssv776060, nssv1175297, nssv1175617, nssv776041, nssv776189, nssv776338, nssv776120, nssv776289, nssv1174426, nssv1174341, nssv776316, nssv1175594, nssv1174418, nssv776121, nssv1175583, nssv776230, nssv1175334, nssv1175330, nssv776323, nssv1174383, nssv776243, nssv1175298, nssv1174414, nssv1175598, nssv1175572, nssv1175710, nssv1174387, nssv776361, nssv776075, nssv1175631, nssv1175580, nssv1174316, nssv776064, nssv1174310, nssv776073, nssv1175611, nssv1174428, nssv776036, nssv776032, nssv1174375, nssv1174352, nssv776303, nssv776045, nssv1175299, nssv1175276, nssv776257, nssv1175217, nssv1175321, nssv1175619, nssv776038, nssv1175302, nssv776083, nssv776046, nssv1175273, nssv1175517, nssv1175673, nssv776131, nssv776100, nssv1175270, nssv1175319, nssv776062, nssv1175205, nssv776125, nssv1175700, nssv1175509, nssv1174354, nssv1175516, nssv1175308, nssv1175681, nssv776170, nssv776143, nssv776256, nssv776252, nssv776112, nssv776199, nssv776277, nssv776152, nssv1175492, nssv1175232, nssv1174398, nssv776229, nssv776336, nssv776043, nssv776028, nssv1174332, nssv776056, nssv1175711, nssv1175523, nssv1174416, nssv1174402, nssv776191, nssv1174435, nssv776274, nssv776118, nssv776034, nssv1175513, nssv1175292, nssv1174339, nssv1175548, nssv776232, nssv1175638, nssv1174381, nssv1175584, nssv1175655, nssv776164, nssv1175268, nssv1175280, nssv776133, nssv1175549, nssv1175684, nssv1175301, nssv1175256, nssv776373, nssv776166, nssv1174369, nssv776296, nssv1175588, nssv1174408, nssv1175659, nssv776188, nssv776124, nssv1175662, nssv1175622, nssv1175532, nssv1175294, nssv1175290, nssv1175687, nssv1175206, nssv1175665, nssv1174313, nssv776209, nssv1175667, nssv1175282, nssv1175566, nssv1175262, nssv1175595, nssv1175577, nssv776310, nssv1174397, nssv1175535, nssv1174322, nssv1175494, nssv776261, nssv1174376, nssv776078, nssv776369, nssv1175633, nssv1175204, nssv776084, nssv776246, nssv1174346, nssv1175688, nssv1175314, nssv776241, nssv1175539, nssv776195, nssv1174420, nssv776187, nssv776298, nssv1175288, nssv1175279, nssv1175307, nssv776301, nssv776240, nssv1175498, nssv1175552, nssv776090, nssv776181, nssv1175690, nssv776250, nssv1175680, nssv1175650, nssv1175242, nssv1175658, nssv1175676, nssv1175630, nssv1175624, nssv1174407, nssv776156, nssv776211, nssv1175515, nssv776238, nssv776332, nssv1175621, nssv1174355, nssv776051, nssv1175222, nssv1175642, nssv1175229, nssv1175671, nssv1175233, nssv1175697, nssv776225, nssv776042, nssv776094, nssv1174372, nssv776254, nssv776136, nssv1175587, nssv776365, nssv776370, nssv1175641, nssv1175303, nssv776163, nssv1174378, nssv776270, nssv1175698, nssv1175269, nssv1175213, nssv1175201, nssv1174343, nssv1174315, nssv776220, nssv776182, nssv1175542, nssv776061, nssv776098, nssv1175585, nssv1175668, nssv1175332, nssv1175537, nssv1175678, nssv1175493, nssv1175224, nssv776111, nssv1175333, nssv1174337, nssv776178, nssv1175615, nssv1175198, nssv776375, nssv1175251, nssv776110, nssv1175653, nssv776288, nssv776376, nssv776214, nssv1175547, nssv1174321, nssv776364, nssv776193, nssv1175590, nssv1175609, nssv1175563, nssv776200, nssv1175569, nssv1175318, nssv776221, nssv1175674, nssv1174406, nssv776159, nssv776101, nssv1175508, nssv776268, nssv1175561, nssv776291, nssv776146, nssv1175223, nssv1175315, nssv1175663, nssv1175272, nssv1175567, nssv776299, nssv776255, nssv1175556, nssv776222, nssv1175248, nssv1175646, nssv776031, nssv776127, nssv1174386, nssv776139, nssv1175243, nssv1174345, nssv776054, nssv776050, nssv1175672, nssv1175527, nssv776233, nssv776030, nssv1175614, nssv1174323, nssv776267, nssv1175550, nssv776294, nssv1175289, nssv776184, nssv1175691, nssv1175616, nssv776249, nssv776141, nssv776093, nssv776037, nssv776079, nssv1174371, nssv776353, nssv776318, nssv776264, nssv776137, nssv776119, nssv1175261, nssv1174340, nssv776328, nssv1175555, nssv1174382, nssv776052, nssv776337, nssv1175610, nssv1174348, nssv776329, nssv1174377, nssv776334, nssv1175603, nssv1174308, nssv776167, nssv776104, nssv776300, nssv1174415, nssv1174370, nssv776144, nssv1175310, nssv776150, nssv1175713, nssv776371, nssv776095, nssv776219, nssv1174394, nssv776067, nssv1175306, nssv1174380, nssv776354, nssv1175504, nssv1175578, nssv1175696, nssv1174429, nssv1175200, nssv776271, nssv776213, nssv1175285, nssv1174403, nssv1175634, nssv1175651, nssv1174411, nssv776275, nssv1175500, nssv1175560, nssv776344, nssv1174389, nssv1175316, nssv1175215, nssv776201, nssv776192, nssv1175573, nssv1175664, nssv776096, nssv1175324, nssv1175226, nssv776108, nssv1175685, nssv776224, nssv776208, nssv1175228, nssv1174385, nssv776260, nssv1174319, nssv776362, nssv1175708, nssv1175284, nssv1175600, nssv1175241, nssv776194, nssv1175559, nssv1175652, nssv1175644, nssv1175239, nssv1175521, nssv1175221, nssv776202, nssv1174409, nssv1174307, nssv1174357, nssv776348, nssv776148, nssv1175514, nssv776105, nssv776347, nssv1175254, nssv1175570, nssv776206, nssv1174347, nssv776239, nssv1174395, nssv776367, nssv776290, nssv1175219, nssv1175257, nssv1174399, nssv1175574, nssv776074, nssv1174400, nssv1174417, nssv776172, nssv776306, nssv1174331, nssv1175528, nssv1174405, nssv1174365, nssv776072, nssv1175599, nssv1175328, nssv1174412, nssv776173, nssv1175519, nssv1175304, nssv1175592, nssv1175625, nssv1175244, nssv1175212, nssv1174317, nssv1175526, nssv776253, nssv776176, nssv1175602, nssv776092, nssv776091, nssv1175311, nssv776242, nssv1175522, nssv1175533, nssv1175589, nssv1174390, nssv1175502, nssv776186, nssv776343, nssv1175520, nssv776047, nssv1175597, nssv1175237, nssv776304, nssv1175208, nssv776179, nssv776155, nssv1174314, nssv776114, nssv1175495, nssv1175618, nssv1175645, nssv1174360, nssv776190, nssv1175579, nssv776293, nssv776313, nssv1175582, nssv1175490, nssv776234, nssv776151, nssv776089, nssv776284, nssv776330, nssv776029, nssv776266, nssv1175620, nssv1175591, nssv1174379, nssv1175554, nssv776356, nssv1175501, nssv1175568, nssv1175536, nssv776377, nssv776077, nssv1175531, nssv1174324, nssv1175260, nssv1174366, nssv1175693, nssv1175267, nssv1175565, nssv1175627, nssv1174338, nssv1175286, nssv1175197, nssv776245, nssv776285, nssv776116, nssv1175499, nssv1175529, nssv1175218, nssv776205, nssv776280, nssv1175666, nssv776283, nssv1175546, nssv776357, nssv776175, nssv1175235, nssv776216, nssv1175553, nssv776302, nssv1175511, nssv1174361, nssv776312, nssv776217, nssv776071, nssv776203, nssv1175506, nssv1175613, nssv776057, nssv776317, nssv1175305, nssv1175246, nssv776128, nssv1175629, nssv1175701, nssv1174413, nssv1175632, nssv1175283, nssv1175656, nssv776295, nssv776237, nssv1174320, nssv1175265, nssv776258, nssv776171, nssv1175604, nssv776027, nssv1175636, nssv1175225, nssv1174367, nssv1175281, nssv776066, nssv1175639, nssv776197, nssv1175706, nssv1175593, nssv1175489, nssv1175608, nssv1175264, nssv1175295, nssv776204, nssv1175649, nssv1175325, nssv776378, nssv776129, nssv1175196, nssv1175564, nssv1174359, nssv1174349, nssv776212, nssv1174312, nssv776082, nssv776341, nssv1175695, nssv1175296, nssv1175238, nssv776183, nssv776070, nssv1175327, nssv776279, nssv1174334, nssv1175227, nssv1175216, nssv1175544, nssv776265, nssv1175612, nssv1174311, nssv776287, nssv1175214, nssv776273, nssv776340, nssv776196, nssv776177, nssv1175323, nssv776272, nssv776223, nssv1175606, nssv1175240, nssv776307, nssv1175682, nssv1175230, nssv776350, nssv776103, nssv1175648, nssv776346, nssv1175596, nssv776160, nssv1174396, nssv1174344, nssv1175524, nssv1174350, nssv776319, nssv776169, nssv776309, nssv1175628, nssv1175660, nssv776207, nssv776335, nssv776321, nssv1175689, nssv1175571, nssv776360, nssv776044, nssv776326, nssv776161, nssv1175575, nssv1174427, nssv1175497, nssv1175576, nssv776368, nssv776180, nssv1175507, nssv776352, nssv776314, nssv776281, nssv1175545, nssv776113, nssv776236, nssv776138, nssv776251, nssv1174326, nssv1175709, nssv776126, nssv1174424, nssv776049, nssv776325, nssv1175669, nssv776076, nssv1175712, nssv1175637, nssv776147, nssv776081, nssv776333, nssv776123, nssv1174373, nssv1175220, nssv1174393, nssv1174358, nssv776235, nssv1175586, nssv1175551, nssv776263, nssv1175534, nssv1175277, nssv1175203, nssv776311, nssv1175512, nssv1175259, nssv1174388, nssv1174356, nssv1174318, nssv776322, nssv776165, nssv1175503, nssv1175699, nssv776055, nssv1175210, nssv776276, nssv776262, nssv776130, nssv776026, nssv1175491 | | Samples | HGDP00722, HGDP01062, HGDP00964, HGDP01247, 1780862402_A, HGDP01385, HGDP01235, HGDP00770, HGDP00543, HGDP00433, HGDP00479, HGDP00851, NINDS_58, HGDP01250, HGDP00724, NINDS_119, HGDP01288, 1780854446_A, 1780854445_A, 1798860072_A, HGDP00717, 1780854439_A, HGDP01352, 1782681109_A, HGDP00013, HGDP00120, 1780862294_A, HGDP00785, HGDP01059, HGDP00695, 1780862381_A, HGDP00624, HGDP00153, 1780862452_A, NINDS_74, HGDP01069, 1780862078_A, HGDP01101, HGDP00850, 1780854016_A, 1780862075_A, HGDP01164, HGDP00919, 1780854176_A, HGDP00551, HGDP00141, 1780854558_A, HGDP00764, HGDP00756, HGDP00090, 1798860592_A, NINDS_87, HGDP00298, 1787431197_A, HGDP00183, 1782681110_A, NINDS_4, 1780862392_A, 1780862596_A, 1780862443_A, HGDP01259, HGDP01071, 1798860306_A, NINDS_29, HGDP01328, HGDP00588, 1798860049_A, NINDS_3, 1780854341_A, 1780862408_A, HGDP00356, HGDP01371, HGDP00779, HGDP00857, NINDS_89, NINDS_102, HGDP01321, NINDS_160, HGDP00852, HGDP00865, HGDP00623, 1780862301_A, NINDS_221, HGDP00879, HGDP00727, HGDP01073, HGDP01348, HGDP01253, HGDP00874, 1782681317_A, HGDP01329, 1780854325_A, NINDS_244, HGDP00670, HGDP00975, HGDP00864, HGDP01039, HGDP00620, HGDP00086, HGDP00818, NINDS_71, 1780862161_A, HGDP01228, HGDP01100, 1780862584_A, 1780862334_A, HGDP01358, HGDP01076, 1780854382_A, HGDP00743, HGDP00600, HGDP00163, HGDP01041, 1780854496_A, NINDS_80, HGDP00663, 1780854574_A, 1780862252_A, HGDP00610, 1780862100_A, HGDP00017, NINDS_196, HGDP01147, HGDP00716, NINDS_149, HGDP00863, HGDP00049, HGDP00702, 1798860570_A, HGDP00732, HGDP00341, 1780862001_A, NINDS_231, HGDP00685, 1780854463_A, HGDP01194, 1798860552_A, HGDP00846, 1782681219_A, HGDP01210, NINDS_272, 1780854158_A, HGDP00154, HGDP00725, HGDP00554, 1780862007_A, HGDP01267, NINDS_103, HGDP01204, 1782681294_A, NINDS_211, HGDP00579, HGDP01269, HGDP00563, 1780862540_A, HGDP01177, 1780854219_A, HGDP00105, HGDP00288, HGDP00802, HGDP01312, HGDP00548, HGDP00956, 1780862592_A, HGDP00699, 1780862080_A, 1780854129_A, 1780862393_A, HGDP01363, HGDP00553, HGDP01263, HGDP01154, HGDP01200, HGDP01054, HGDP01063, NINDS_109, 1780862388_A, 1780854334_A, HGDP01271, HGDP00862, HGDP00834, 1780862180_A, 1798860047_A, NINDS_81, HGDP01008, 1780862020_A, HGDP00658, 1780862565_A, HGDP00840, HGDP01266, HGDP00889, HGDP00124, HGDP00041, 1780854444_A, HGDP00971, HGDP00655, HGDP00830, HGDP00423, HGDP00823, 1780862461_A, HGDP00654, HGDP00882, HGDP00567, HGDP00185, 1780854198_A, NINDS_193, 1782681263_A, NINDS_240, NINDS_100, NINDS_230, NINDS_171, HGDP00019, HGDP00741, HGDP00789, HGDP00054, 1780862125_A, HGDP00662, HGDP00978, HGDP00930, 1780862466_A, HGDP00613, HGDP00625, HGDP01370, 1780854216_A, NINDS_114, HGDP00769, HGDP00866, HGDP01244, HGDP01245, HGDP00574, HGDP00718, 1780862300_A, HGDP00921, HGDP00656, HGDP01018, HGDP00847, HGDP00710, HGDP01376, HGDP00781, HGDP00102, HGDP01027, HGDP00917, HGDP00615, HGDP00572, HGDP00927, 1780862403_A, 1780854017_A, NINDS_134, HGDP00359, HGDP01277, HGDP00515, HGDP00890, HGDP00855, HGDP00187, NINDS_207, 1782681024_A, HGDP00161, HGDP00333, HGDP00011, HGDP00745, HGDP00594, NINDS_101, HGDP01174, 1780862554_A, 1780854484_A, NINDS_259, HGDP00792, 1780862304_A, 1780854436_A, HGDP01195, HGDP00647, 1780862339_A, HGDP00835, 1780862599_A, HGDP01402, HGDP00491, 1780862274_A, HGDP01056, 1780854130_A, HGDP01347, HGDP00813, HGDP01350, HGDP00629, HGDP01377, HGDP00568, 1780862563_A, HGDP01217, 1780854318_A, NINDS_246, HGDP00837, NINDS_155, HGDP00191, 1780854592_A, HGDP00856, HGDP00821, HGDP00279, HGDP00428, HGDP00806, HGDP00060, HGDP00372, HGDP00878, HGDP00129, 1780862275_A, 1780854567_A, NINDS_22, 1798860166_A, NINDS_253, HGDP00080, HGDP01205, 1780862559_A, 1780854462_A, 1780862424_A, NINDS_124, HGDP01298, 1780862229_A, HGDP00707, HGDP00828, 1798860336_A, HGDP01203, HGDP00609, HGDP00556, NINDS_129, 1780854210_A, HGDP00084, HGDP00035, NINDS_206, HGDP00558, HGDP01261, 1780862551_A, HGDP01306, HGDP00146, 1782681116_A, HGDP01016, 1780862109_A, HGDP00869, HGDP00807, HGDP00884, HGDP00642, NINDS_97, 1780862448_A, HGDP00033, HGDP00052, HGDP01050, HGDP00539, HGDP00748, HGDP00037, 1780862084_A, 1780854392_A, HGDP01078, 1780862066_A, HGDP00790, HGDP00131, HGDP01057, 1782681099_A, HGDP01042, HGDP00844, NINDS_203, HGDP00110, 1782681495_A, NINDS_76, HGDP00861, 1780862094_A, NINDS_179, 1780862435_A, HGDP00130, HGDP00709, HGDP00916, 1780854485_A, HGDP01294, HGDP00618, HGDP01221, HGDP00972, HGDP00664, HGDP01317, NINDS_17, 1780846005_A, HGDP00135, HGDP00833, HGDP00262, HGDP00730, HGDP00860, HGDP00849, 1780862530_A, HGDP00290, HGDP01308, HGDP00529, HGDP00023, 1780854336_A, 1780862162_A, HGDP00935, HGDP00999, HGDP01258, HGDP01152, HGDP00758, NINDS_39, 1782681287_A, HGDP01184, HGDP00604, HGDP00598, 1780862574_A, 1780862299_A, HGDP01001, HGDP00998, HGDP00694, NINDS_115, 1780862539_A, HGDP01309, 1782681080_A, HGDP00541, 1780854294_A, HGDP01053, HGDP00696, HGDP00244, HGDP00787, HGDP00766, NINDS_105, 1780862576_A, NINDS_192, 1780862401_A, NINDS_254, HGDP00570, HGDP00845, HGDP01388, NINDS_45, HGDP00898, HGDP00872, 1780862404_A, HGDP00749, HGDP01046, HGDP01067, 1780862419_A, HGDP01103, 1780862156_A, NINDS_9, NINDS_241, HGDP01387, HGDP00843, HGDP00015, HGDP00720, HGDP01072, HGDP01213, HGDP00591, 1780854302_A, HGDP00672, HGDP00762, HGDP00683, 1780862101_A, HGDP00839, HGDP00197, HGDP01043, HGDP00938, HGDP00973, 1780862041_A, HGDP00697, HGDP00841, 1780862043_A, HGDP00388, HGDP00969, HGDP00064, 1780862597_A, HGDP01173, HGDP00746, HGDP00058, HGDP00900, HGDP00160, HGDP01058, 1798860251_A, HGDP00622, 1782681102_A, HGDP00490, NINDS_99, HGDP00171, HGDP00780, HGDP01366, 1780862021_A, 1780854568_A, HGDP00583, 1780854511_A, NINDS_222, HGDP01275, HGDP00825, HGDP01305, HGDP00838, HGDP00402, HGDP01045, HGDP00711, HGDP01044, HGDP00859, HGDP00773, 1780862437_A, HGDP01000, HGDP00961, 1780862379_A, 1780862432_A | | Known Genes | OR4C11, OR4C6, OR4P4, OR4S2 | | Method | SNP array | | Analysis | Illumina SNP array copy number analysis | | Platform | Not reported | | Comments | | | Reference | Cooper_et_al_2011 | | Pubmed ID | 21841781 | | Accession Number(s) | nsv554897
| | Frequency | | Sample Size | 17421 | | Observed Gain | 49 | | Observed Loss | 799 | | Observed Complex | 0 | | Frequency | n/a |
|
|
