A curated catalogue of human genomic structural variation

Variant Details

Variant: nsv1059526

Internal ID

18802057

Landmark

Location Information

Type	Coordinates	Assembly	Other Links
Inner	chr20:54031269..54042100	hg38	UCSC Ensembl
Inner	chr20:52647808..52658639	hg19	UCSC Ensembl
Inner	chr20:52081215..52092046	hg18	UCSC Ensembl

Cytoband

20q13.2

Allele length

Assembly	Allele length
hg38	10832
hg19	10832
hg18	10832

Variant Type

CNV loss

Copy Number

Allele State

Allele Origin

Probe Count

Validation Flag

Merged Status

M

Merged Variants

Supporting Variants

nssv3586182, nssv3586317, nssv3586122, nssv3731411, nssv3586240, nssv3731439, nssv3586160, nssv3731433, nssv3586315, nssv3731432, nssv3586322, nssv3586281, nssv3731397, nssv3586148, nssv3586193, nssv3586313, nssv3586113, nssv3586312, nssv3586161, nssv3586185, nssv3586165, nssv3586260, nssv3731420, nssv3586257, nssv3586111, nssv3586243, nssv3586168, nssv3586137, nssv3586279, nssv3586213, nssv3586153, nssv3731466, nssv3731427, nssv3586167, nssv3586147, nssv3586206, nssv3586355, nssv3586350, nssv3586280, nssv3731408, nssv3586318, nssv3731430, nssv3586328, nssv3586262, nssv3586345, nssv3731423, nssv3731441, nssv3586376, nssv3586292, nssv3586253, nssv3731398, nssv3586132, nssv3586264, nssv3586112, nssv3586244, nssv3586239, nssv3731381, nssv3586360, nssv3731456, nssv3731443, nssv3586311, nssv3586155, nssv3586115, nssv3731434, nssv3586234, nssv3586251, nssv3586365, nssv3586357, nssv3586133, nssv3731376, nssv3586146, nssv3586343, nssv3731409, nssv3586373, nssv3586363, nssv3586177, nssv3586236, nssv3586330, nssv3586299, nssv3586158, nssv3731445, nssv3586323, nssv3586278, nssv3731458, nssv3586284, nssv3586362, nssv3586266, nssv3731438, nssv3586308, nssv3586324, nssv3586338, nssv3586197, nssv3586191, nssv3731377, nssv3586267, nssv3731410, nssv3731418, nssv3586242, nssv3586275, nssv3586166, nssv3586306, nssv3586172, nssv3586149, nssv3586114, nssv3586258, nssv3586202, nssv3586196, nssv3586320, nssv3586270, nssv3731475, nssv3731461, nssv3586301, nssv3586249, nssv3586224, nssv3586333, nssv3586151, nssv3731429, nssv3586271, nssv3586124, nssv3586246, nssv3731402, nssv3586366, nssv3586339, nssv3586139, nssv3586143, nssv3586369, nssv3731384, nssv3586199, nssv3586235, nssv3586152, nssv3586117, nssv3731392, nssv3586342, nssv3731399, nssv3586316, nssv3586190, nssv3731428, nssv3586173, nssv3731394, nssv3586375, nssv3586237, nssv3586274, nssv3586140, nssv3586174, nssv3731446, nssv3586128, nssv3586118, nssv3586121, nssv3586293, nssv3586231, nssv3586189, nssv3586371, nssv3586364, nssv3731469, nssv3586233, nssv3586228, nssv3731413, nssv3586220, nssv3586129, nssv3731435, nssv3586141, nssv3586119, nssv3586227, nssv3731419, nssv3586179, nssv3586272, nssv3586144, nssv3586192, nssv3586335, nssv3586309, nssv3731437, nssv3586273, nssv3586226, nssv3586380, nssv3586181, nssv3586156, nssv3586349, nssv3586127, nssv3731425, nssv3731379, nssv3586307, nssv3586381, nssv3586352, nssv3586326, nssv3586269, nssv3586131, nssv3731407, nssv3586304, nssv3731451, nssv3731417, nssv3586294, nssv3586208, nssv3586319, nssv3586261, nssv3586198, nssv3586259, nssv3731380, nssv3586103, nssv3731459, nssv3731452, nssv3586170, nssv3586302, nssv3586110, nssv3586283, nssv3586183, nssv3586207, nssv3586217, nssv3586214, nssv3586116, nssv3586337, nssv3586341, nssv3586188, nssv3731426, nssv3731460, nssv3586215, nssv3586221, nssv3731396, nssv3586178, nssv3586329, nssv3586321, nssv3731385, nssv3586358, nssv3586327, nssv3731431, nssv3731404, nssv3586203, nssv3586370, nssv3586104, nssv3586310, nssv3586204, nssv3731474, nssv3586109, nssv3586184, nssv3586289, nssv3586159, nssv3586374, nssv3586347, nssv3586209, nssv3586238, nssv3731393, nssv3731388, nssv3586120, nssv3731454, nssv3586210, nssv3586285, nssv3586282, nssv3586287, nssv3586255, nssv3586356, nssv3586252, nssv3586216, nssv3586377, nssv3586325, nssv3586297, nssv3731400, nssv3586379, nssv3586298, nssv3586223, nssv3586126, nssv3586332, nssv3731382, nssv3586254, nssv3731462, nssv3731455, nssv3731383, nssv3731447, nssv3586353, nssv3586305, nssv3731401, nssv3586291, nssv3731378, nssv3586225, nssv3586108, nssv3731468, nssv3586361, nssv3586145, nssv3731405, nssv3586163, nssv3731467, nssv3586348, nssv3586367, nssv3731442, nssv3731386, nssv3586171, nssv3586106, nssv3731465, nssv3731415, nssv3586200, nssv3731457, nssv3586334, nssv3586212, nssv3586142, nssv3586187, nssv3586150, nssv3586378, nssv3731444, nssv3586180, nssv3586331, nssv3586247, nssv3586157, nssv3586136, nssv3586250, nssv3586248, nssv3586303, nssv3731449, nssv3586195, nssv3586176, nssv3731395, nssv3586372, nssv3731453, nssv3586205, nssv3586286, nssv3586277, nssv3586135, nssv3586359, nssv3586295, nssv3586134, nssv3586222, nssv3586186, nssv3731450, nssv3731422, nssv3586245, nssv3586241, nssv3586218, nssv3586232, nssv3586162, nssv3731387, nssv3586340, nssv3586346, nssv3586230, nssv3586194, nssv3586268, nssv3586175, nssv3586211, nssv3586130, nssv3586300, nssv3586296, nssv3731416, nssv3731391, nssv3731463, nssv3586123, nssv3586368, nssv3586290, nssv3731424, nssv3731448, nssv3731470, nssv3731403, nssv3586125, nssv3731389, nssv3586201, nssv3586105, nssv3586314, nssv3586169, nssv3586256, nssv3586354, nssv3731472, nssv3586344, nssv3731473, nssv3586263, nssv3586138, nssv3731440, nssv3731406, nssv3586351, nssv3586154, nssv3586107, nssv3586276, nssv3731412, nssv3731414, nssv3731390, nssv3586288, nssv3586219, nssv3731471, nssv3731421, nssv3586336, nssv3731436, nssv3731464, nssv3586265, nssv3586229, nssv3586164

Samples

Known Genes

Method

SNP array

Analysis

Affymetrix SNP array copy number analysis

Platform

Affymetrix SNP Array 6.0

Comments

Reference

Coe_et_al_2014

Pubmed ID

Accession Number(s)

Frequency

Sample Size	29084
Observed Gain	0
Observed Loss	379
Observed Complex	0
Frequency	n/a