A curated catalogue of human genomic structural variation

Variant Details

Variant: nsv1058613

Internal ID

18801144

Landmark

Location Information

Type	Coordinates	Assembly	Other Links
Inner	chr19:35358579..35370934	hg38	UCSC Ensembl
Inner	chr19:35849481..35861836	hg19	UCSC Ensembl
Inner	chr19:40541321..40553676	hg18	UCSC Ensembl

Cytoband

19q13.12

Allele length

Assembly	Allele length
hg38	12356
hg19	12356
hg18	12356

Variant Type

CNV gain+loss

Copy Number

Allele State

Allele Origin

Probe Count

Validation Flag

Merged Status

M

Merged Variants

Supporting Variants

nssv3724436, nssv3566729, nssv3566696, nssv3568035, nssv3568076, nssv3567996, nssv3724511, nssv3566772, nssv3568004, nssv3724463, nssv3566769, nssv3568081, nssv3566752, nssv3566748, nssv3566685, nssv3568037, nssv3566787, nssv3568096, nssv3724495, nssv3568072, nssv3724487, nssv3724400, nssv3566740, nssv3568092, nssv3567920, nssv3568065, nssv3568042, nssv3724386, nssv3568104, nssv3566691, nssv3568102, nssv3568033, nssv3566684, nssv3568036, nssv3568009, nssv3724376, nssv3724370, nssv3566799, nssv3724508, nssv3567957, nssv3567968, nssv3724457, nssv3724417, nssv3567977, nssv3566781, nssv3724374, nssv3566803, nssv3568023, nssv3568134, nssv3567951, nssv3566746, nssv3724462, nssv3568053, nssv3568079, nssv3567945, nssv3567969, nssv3566725, nssv3724422, nssv3567988, nssv3724480, nssv3724425, nssv3567937, nssv3566753, nssv3567926, nssv3566680, nssv3568129, nssv3568089, nssv3567986, nssv3567971, nssv3566734, nssv3566765, nssv3568133, nssv3724465, nssv3724426, nssv3566737, nssv3566694, nssv3566796, nssv3568070, nssv3724421, nssv3724450, nssv3724441, nssv3724405, nssv3568108, nssv3568034, nssv3567998, nssv3724478, nssv3724381, nssv3566716, nssv3566713, nssv3724446, nssv3724443, nssv3724501, nssv3568056, nssv3566709, nssv3568125, nssv3568018, nssv3724398, nssv3568046, nssv3567975, nssv3567981, nssv3724407, nssv3567924, nssv3724459, nssv3566702, nssv3568010, nssv3567944, nssv3724404, nssv3724442, nssv3568109, nssv3567984, nssv3567990, nssv3568003, nssv3568099, nssv3566699, nssv3724424, nssv3566775, nssv3567928, nssv3567917, nssv3566766, nssv3724468, nssv3566711, nssv3567930, nssv3566701, nssv3566714, nssv3724486, nssv3567918, nssv3566757, nssv3566682, nssv3568130, nssv3567987, nssv3566795, nssv3566779, nssv3568064, nssv3568038, nssv3566722, nssv3724472, nssv3724451, nssv3567997, nssv3567916, nssv3566715, nssv3568086, nssv3566764, nssv3566720, nssv3566723, nssv3566687, nssv3568118, nssv3724505, nssv3724391, nssv3566750, nssv3724432, nssv3566774, nssv3566744, nssv3566793, nssv3724461, nssv3724372, nssv3567933, nssv3567991, nssv3566733, nssv3724420, nssv3724411, nssv3567992, nssv3568100, nssv3568101, nssv3724380, nssv3566751, nssv3566686, nssv3568024, nssv3568060, nssv3568121, nssv3568113, nssv3567939, nssv3567938, nssv3566773, nssv3567956, nssv3566762, nssv3567950, nssv3568093, nssv3566749, nssv3566695, nssv3724414, nssv3568114, nssv3724510, nssv3724412, nssv3566739, nssv3568001, nssv3566745, nssv3724447, nssv3567927, nssv3568110, nssv3568013, nssv3566789, nssv3724440, nssv3568048, nssv3567979, nssv3724500, nssv3567936, nssv3724385, nssv3567982, nssv3724482, nssv3568040, nssv3568078, nssv3724418, nssv3724369, nssv3568055, nssv3566689, nssv3724396, nssv3568007, nssv3568119, nssv3567974, nssv3566801, nssv3566777, nssv3566731, nssv3566707, nssv3568017, nssv3567954, nssv3567929, nssv3724493, nssv3724371, nssv3567946, nssv3568103, nssv3568085, nssv3567952, nssv3568135, nssv3568097, nssv3566790, nssv3567942, nssv3566798, nssv3566771, nssv3568066, nssv3567994, nssv3567978, nssv3566730, nssv3568115, nssv3724388, nssv3568095, nssv3724502, nssv3724399, nssv3567934, nssv3566783, nssv3568112, nssv3724455, nssv3568083, nssv3724469, nssv3568021, nssv3568032, nssv3568027, nssv3724431, nssv3566776, nssv3566791, nssv3567935, nssv3724408, nssv3724454, nssv3566792, nssv3724434, nssv3724435, nssv3724497, nssv3568063, nssv3567949, nssv3724473, nssv3567915, nssv3568006, nssv3567963, nssv3568131, nssv3567922, nssv3568087, nssv3568054, nssv3567912, nssv3724406, nssv3568111, nssv3568043, nssv3568044, nssv3566754, nssv3724464, nssv3568026, nssv3568090, nssv3566728, nssv3568047, nssv3567931, nssv3724490, nssv3568077, nssv3568011, nssv3567973, nssv3568050, nssv3724449, nssv3566782, nssv3568127, nssv3724466, nssv3568005, nssv3566693, nssv3568062, nssv3566804, nssv3568052, nssv3567941, nssv3567919, nssv3566778, nssv3568069, nssv3724475, nssv3566721, nssv3566738, nssv3724489, nssv3724507, nssv3568045, nssv3566755, nssv3566679, nssv3566800, nssv3724494, nssv3568124, nssv3568015, nssv3568123, nssv3568128, nssv3567989, nssv3568002, nssv3724481, nssv3566802, nssv3724428, nssv3724378, nssv3568008, nssv3567948, nssv3566706, nssv3724415, nssv3724467, nssv3568098, nssv3724470, nssv3567993, nssv3568094, nssv3567943, nssv3566712, nssv3724379, nssv3568088, nssv3568014, nssv3724503, nssv3567967, nssv3566780, nssv3568082, nssv3566756, nssv3567958, nssv3568016, nssv3566767, nssv3724445, nssv3566719, nssv3566717, nssv3567953, nssv3566704, nssv3724509, nssv3567961, nssv3568084, nssv3568051, nssv3724433, nssv3567983, nssv3568105, nssv3567962, nssv3566718, nssv3724377, nssv3568132, nssv3724483, nssv3567925, nssv3566724, nssv3567914, nssv3567955, nssv3566688, nssv3724402, nssv3568031, nssv3724484, nssv3724499, nssv3724491, nssv3724387, nssv3568025, nssv3568057, nssv3566770, nssv3566794, nssv3568030, nssv3567985, nssv3567999, nssv3724382, nssv3568075, nssv3566758, nssv3567921, nssv3566763, nssv3724456, nssv3724453, nssv3566735, nssv3566797, nssv3724504, nssv3568019, nssv3568049, nssv3724429, nssv3568039, nssv3568028, nssv3566743, nssv3724373, nssv3566741, nssv3566690, nssv3566784, nssv3566759, nssv3724488, nssv3724410, nssv3567970, nssv3568012, nssv3724397, nssv3566786, nssv3724506, nssv3724438, nssv3568122, nssv3566788, nssv3724492, nssv3724452, nssv3566760, nssv3724394, nssv3568041, nssv3566697, nssv3568074, nssv3567972, nssv3567995, nssv3724476, nssv3567932, nssv3724496, nssv3568091, nssv3568116, nssv3566681, nssv3724474, nssv3567923, nssv3724471, nssv3724423, nssv3567960, nssv3724437, nssv3567940, nssv3566700, nssv3724413, nssv3568059, nssv3567959, nssv3566742, nssv3568126, nssv3566708, nssv3568073, nssv3566710, nssv3568022, nssv3566768, nssv3724389, nssv3566761, nssv3724427, nssv3567976, nssv3566683, nssv3566705, nssv3568000, nssv3566727, nssv3568020, nssv3566785, nssv3724444, nssv3724395, nssv3724393, nssv3724383, nssv3724477, nssv3724390, nssv3724368, nssv3724375, nssv3567980, nssv3724479, nssv3568067, nssv3568029, nssv3567965, nssv3724448, nssv3567966, nssv3568071, nssv3567964, nssv3724460, nssv3566692, nssv3568068, nssv3724401, nssv3568058, nssv3566736, nssv3724439, nssv3724498, nssv3724392, nssv3566747, nssv3724384, nssv3568117, nssv3568080, nssv3724458, nssv3567913, nssv3566698, nssv3724409, nssv3724485, nssv3567947, nssv3566732, nssv3568107, nssv3566703, nssv3568061, nssv3724430, nssv3568106, nssv3724416, nssv3566726, nssv3724419, nssv3568120, nssv3724403

Samples

Known Genes

Method

SNP array

Analysis

Affymetrix SNP array copy number analysis

Platform

Affymetrix SNP Array 6.0

Comments

Reference

Coe_et_al_2014

Pubmed ID

Accession Number(s)

Frequency

Sample Size	29084
Observed Gain	11
Observed Loss	483
Observed Complex	0
Frequency	n/a