A curated catalogue of human genomic structural variation

Variant Details

Variant: nsv1031811

Internal ID

19121033

Landmark

Location Information

Type	Coordinates	Assembly	Other Links
Inner	chr8:39378072..39531593	hg38	UCSC Ensembl
Inner	chr8:39235591..39389112	hg19	UCSC Ensembl
Inner	chr8:39354748..39508269	hg18	UCSC Ensembl

Cytoband

8p11.22

Allele length

Assembly	Allele length
hg38	153522
hg19	153522
hg18	153522

Variant Type

CNV gain+loss

Copy Number

Allele State

Allele Origin

Probe Count

Validation Flag

Merged Status

M

Merged Variants

Supporting Variants

nssv3686362, nssv3686282, nssv3686288, nssv3756648, nssv3686262, nssv3686251, nssv3686321, nssv3686259, nssv3686296, nssv3686389, nssv3686284, nssv3686400, nssv3686348, nssv3686291, nssv3686315, nssv3756642, nssv3686342, nssv3686333, nssv3686229, nssv3686272, nssv3686347, nssv3686352, nssv3686350, nssv3756643, nssv3686227, nssv3686224, nssv3686366, nssv3756645, nssv3686301, nssv3686278, nssv3686385, nssv3686346, nssv3686322, nssv3686225, nssv3686328, nssv3686339, nssv3686413, nssv3686318, nssv3686221, nssv3686220, nssv3686372, nssv3686290, nssv3686293, nssv3686397, nssv3686388, nssv3686267, nssv3686250, nssv3686242, nssv3686344, nssv3686312, nssv3686257, nssv3756640, nssv3686420, nssv3686319, nssv3686280, nssv3756637, nssv3686355, nssv3686256, nssv3756641, nssv3686239, nssv3686398, nssv3686407, nssv3686368, nssv3686235, nssv3686365, nssv3686364, nssv3686354, nssv3686263, nssv3686240, nssv3686313, nssv3686249, nssv3686248, nssv3686237, nssv3756639, nssv3686374, nssv3686409, nssv3686274, nssv3686236, nssv3686405, nssv3686234, nssv3686414, nssv3686330, nssv3686383, nssv3686373, nssv3686325, nssv3686308, nssv3686286, nssv3686260, nssv3686419, nssv3686269, nssv3686417, nssv3686395, nssv3686357, nssv3686380, nssv3686329, nssv3686359, nssv3686377, nssv3686375, nssv3686306, nssv3686264, nssv3686297, nssv3686276, nssv3756632, nssv3686393, nssv3686304, nssv3686392, nssv3686387, nssv3686243, nssv3686244, nssv3686401, nssv3686381, nssv3686298, nssv3686223, nssv3686254, nssv3686376, nssv3686232, nssv3686279, nssv3686273, nssv3686408, nssv3686371, nssv3686289, nssv3686246, nssv3686238, nssv3686222, nssv3686386, nssv3686356, nssv3686382, nssv3686230, nssv3686332, nssv3686255, nssv3686311, nssv3756633, nssv3686307, nssv3686369, nssv3686335, nssv3686303, nssv3686370, nssv3686396, nssv3686233, nssv3756646, nssv3686340, nssv3686287, nssv3686326, nssv3686258, nssv3686252, nssv3686320, nssv3686410, nssv3686412, nssv3686399, nssv3686261, nssv3686268, nssv3686226, nssv3686294, nssv3686275, nssv3686331, nssv3686402, nssv3686309, nssv3686415, nssv3686334, nssv3686285, nssv3686367, nssv3686351, nssv3686343, nssv3686247, nssv3686266, nssv3686327, nssv3686228, nssv3756647, nssv3686394, nssv3686421, nssv3686231, nssv3686300, nssv3686336, nssv3686378, nssv3686390, nssv3686349, nssv3686416, nssv3686265, nssv3686360, nssv3686314, nssv3686404, nssv3686384, nssv3686323, nssv3686338, nssv3686317, nssv3756638, nssv3686358, nssv3686353, nssv3686345, nssv3686418, nssv3686379, nssv3686305, nssv3686277, nssv3686391, nssv3686283, nssv3686270, nssv3686363, nssv3686337, nssv3686316, nssv3756644, nssv3686341, nssv3686253, nssv3756634, nssv3686411, nssv3686361, nssv3686292, nssv3686406, nssv3686281, nssv3686241, nssv3686302, nssv3686295, nssv3686310, nssv3756636, nssv3686271, nssv3686403, nssv3756635, nssv3686324, nssv3686299, nssv3686245

Samples

Known Genes

Method

SNP array

Analysis

Affymetrix SNP array copy number analysis

Platform

Affymetrix SNP Array 6.0

Comments

Reference

Coe_et_al_2014

Pubmed ID

Accession Number(s)

Frequency

Sample Size	11257
Observed Gain	216
Observed Loss	3
Observed Complex	0
Frequency	n/a