A curated catalogue of human genomic structural variation

Variant Details

Variant: nsv1027013

Internal ID

19116232

Landmark

Location Information

Type	Coordinates	Assembly	Other Links
Inner	chr6:257341..294825	hg38	UCSC Ensembl
Inner	chr6:257341..294825	hg19	UCSC Ensembl
Inner	chr6:202341..239825	hg18	UCSC Ensembl

Cytoband

6p25.3

Allele length

Assembly	Allele length
hg38	37485
hg19	37485
hg18	37485

Variant Type

CNV gain+loss

Copy Number

Allele State

Allele Origin

Probe Count

Validation Flag

Merged Status

M

Merged Variants

Supporting Variants

nssv3650543, nssv3650533, nssv3747582, nssv3651434, nssv3650526, nssv3651406, nssv3746782, nssv3651414, nssv3651311, nssv3651463, nssv3651373, nssv3650551, nssv3650510, nssv3651316, nssv3746799, nssv3651401, nssv3651318, nssv3651332, nssv3651384, nssv3651381, nssv3651331, nssv3650503, nssv3747559, nssv3651460, nssv3746786, nssv3651457, nssv3650532, nssv3747543, nssv3651304, nssv3650513, nssv3651464, nssv3651454, nssv3651320, nssv3651368, nssv3651354, nssv3651396, nssv3651351, nssv3651442, nssv3651342, nssv3651319, nssv3747554, nssv3651411, nssv3650536, nssv3747585, nssv3651347, nssv3651296, nssv3650541, nssv3650491, nssv3747566, nssv3650506, nssv3651377, nssv3651425, nssv3651399, nssv3650485, nssv3746804, nssv3747547, nssv3651410, nssv3651391, nssv3650547, nssv3651346, nssv3650527, nssv3650498, nssv3747545, nssv3651465, nssv3651380, nssv3651322, nssv3651394, nssv3651428, nssv3651473, nssv3651435, nssv3650542, nssv3746798, nssv3651383, nssv3651306, nssv3651374, nssv3650500, nssv3650530, nssv3651360, nssv3651446, nssv3650552, nssv3651295, nssv3651366, nssv3651300, nssv3651386, nssv3651339, nssv3651404, nssv3747556, nssv3650548, nssv3747581, nssv3651444, nssv3651418, nssv3650488, nssv3746788, nssv3651317, nssv3746789, nssv3651451, nssv3651343, nssv3651367, nssv3651352, nssv3651419, nssv3650539, nssv3651308, nssv3651303, nssv3651341, nssv3747574, nssv3651357, nssv3651325, nssv3651458, nssv3650490, nssv3650504, nssv3747558, nssv3651421, nssv3651337, nssv3651441, nssv3650502, nssv3651299, nssv3650509, nssv3651408, nssv3650538, nssv3746797, nssv3651297, nssv3747553, nssv3651326, nssv3651294, nssv3651472, nssv3651424, nssv3651362, nssv3651379, nssv3651336, nssv3651440, nssv3650544, nssv3651456, nssv3747560, nssv3650499, nssv3651423, nssv3651350, nssv3747561, nssv3651376, nssv3651349, nssv3651312, nssv3651422, nssv3651305, nssv3747555, nssv3650523, nssv3651348, nssv3746794, nssv3651474, nssv3651388, nssv3651364, nssv3651293, nssv3651478, nssv3650525, nssv3746787, nssv3651403, nssv3747575, nssv3651321, nssv3651363, nssv3650546, nssv3747576, nssv3651452, nssv3651369, nssv3651338, nssv3747564, nssv3650534, nssv3747578, nssv3651385, nssv3650535, nssv3651448, nssv3651334, nssv3746800, nssv3651389, nssv3651433, nssv3651327, nssv3747573, nssv3651335, nssv3651329, nssv3650489, nssv3746801, nssv3651430, nssv3651353, nssv3651437, nssv3651427, nssv3746792, nssv3651445, nssv3651449, nssv3651443, nssv3651301, nssv3747577, nssv3651461, nssv3651344, nssv3651393, nssv3746783, nssv3747552, nssv3650507, nssv3650511, nssv3747546, nssv3650496, nssv3651330, nssv3747583, nssv3651402, nssv3747550, nssv3747548, nssv3650486, nssv3746802, nssv3651420, nssv3651413, nssv3651392, nssv3747562, nssv3746793, nssv3651365, nssv3747568, nssv3747570, nssv3650519, nssv3651416, nssv3746785, nssv3651390, nssv3650487, nssv3650522, nssv3747571, nssv3651412, nssv3650524, nssv3651372, nssv3650528, nssv3650518, nssv3747572, nssv3747557, nssv3651405, nssv3650514, nssv3651475, nssv3651355, nssv3651361, nssv3651450, nssv3650494, nssv3651436, nssv3746784, nssv3651382, nssv3651328, nssv3650554, nssv3650512, nssv3650492, nssv3651314, nssv3650505, nssv3651431, nssv3651395, nssv3651429, nssv3746795, nssv3747567, nssv3651370, nssv3651439, nssv3651476, nssv3650549, nssv3746796, nssv3650495, nssv3650553, nssv3651324, nssv3650493, nssv3746803, nssv3651459, nssv3746790, nssv3651333, nssv3746791, nssv3651470, nssv3650521, nssv3651466, nssv3651462, nssv3650508, nssv3747551, nssv3651397, nssv3651371, nssv3650515, nssv3651356, nssv3651467, nssv3651468, nssv3650501, nssv3747549, nssv3651417, nssv3651387, nssv3651409, nssv3651358, nssv3650550, nssv3650531, nssv3651398, nssv3651340, nssv3651309, nssv3651471, nssv3651323, nssv3650517, nssv3651432, nssv3651310, nssv3651455, nssv3651477, nssv3651375, nssv3650520, nssv3651359, nssv3651407, nssv3650540, nssv3747569, nssv3747544, nssv3650545, nssv3651426, nssv3747565, nssv3746780, nssv3747584, nssv3651453, nssv3651378, nssv3651307, nssv3650516, nssv3651415, nssv3650537, nssv3650529, nssv3747563, nssv3651313, nssv3651302, nssv3746781, nssv3651447, nssv3651315, nssv3651469, nssv3651345, nssv3651298, nssv3650497, nssv3747580, nssv3651438, nssv3747579, nssv3651400

Samples

Known Genes

Method

SNP array

Analysis

Affymetrix SNP array copy number analysis

Platform

Affymetrix SNP Array 6.0

Comments

Reference

Coe_et_al_2014

Pubmed ID

Accession Number(s)

Frequency

Sample Size	11257
Observed Gain	35
Observed Loss	289
Observed Complex	0
Frequency	n/a