A curated catalogue of human genomic structural variation

Variant Details

Variant: nsv1025348

Internal ID

19114566

Landmark

Location Information

Type	Coordinates	Assembly	Other Links
Inner	chr8:136669376..136850192	hg38	UCSC Ensembl
Inner	chr8:137681619..137862435	hg19	UCSC Ensembl
Inner	chr8:137750801..137931617	hg18	UCSC Ensembl

Cytoband

8q24.23

Allele length

Assembly	Allele length
hg38	180817
hg19	180817
hg18	180817

Variant Type

CNV loss

Copy Number

Allele State

Allele Origin

Probe Count

Validation Flag

Merged Status

M

Merged Variants

Supporting Variants

nssv3757455, nssv3689919, nssv3757444, nssv3689968, nssv3689931, nssv3689946, nssv3689941, nssv3689971, nssv3689824, nssv3757470, nssv3689842, nssv3757421, nssv3689871, nssv3689830, nssv3689940, nssv3689956, nssv3689831, nssv3689819, nssv3689953, nssv3689909, nssv3692797, nssv3757408, nssv3689852, nssv3692795, nssv3692788, nssv3689822, nssv3689937, nssv3689874, nssv3757473, nssv3689918, nssv3757450, nssv3757442, nssv3757418, nssv3757404, nssv3689886, nssv3757423, nssv3689821, nssv3757440, nssv3689912, nssv3692784, nssv3757417, nssv3757431, nssv3689859, nssv3689925, nssv3689832, nssv3689864, nssv3757429, nssv3689848, nssv3757441, nssv3689952, nssv3692790, nssv3689969, nssv3689965, nssv3692792, nssv3689867, nssv3689851, nssv3757469, nssv3689954, nssv3757412, nssv3689882, nssv3757449, nssv3689957, nssv3689926, nssv3689885, nssv3757415, nssv3689889, nssv3757471, nssv3689829, nssv3689963, nssv3689877, nssv3689845, nssv3689917, nssv3689863, nssv3689911, nssv3757406, nssv3689856, nssv3689891, nssv3689906, nssv3757428, nssv3689955, nssv3689894, nssv3689933, nssv3689862, nssv3689962, nssv3757458, nssv3757422, nssv3689904, nssv3689895, nssv3689838, nssv3689961, nssv3689893, nssv3689920, nssv3757453, nssv3757402, nssv3689947, nssv3757443, nssv3757445, nssv3757414, nssv3689883, nssv3757448, nssv3689967, nssv3757424, nssv3689875, nssv3689839, nssv3689923, nssv3689907, nssv3689951, nssv3689890, nssv3689858, nssv3757452, nssv3689902, nssv3689948, nssv3689879, nssv3689818, nssv3757419, nssv3689878, nssv3757405, nssv3689901, nssv3757454, nssv3689884, nssv3689873, nssv3689861, nssv3757462, nssv3689970, nssv3689840, nssv3689922, nssv3689872, nssv3757439, nssv3692786, nssv3757464, nssv3689853, nssv3757427, nssv3757461, nssv3757437, nssv3689892, nssv3689897, nssv3689896, nssv3757463, nssv3689929, nssv3689843, nssv3692785, nssv3689876, nssv3689857, nssv3689880, nssv3689870, nssv3757434, nssv3757416, nssv3689964, nssv3757467, nssv3757401, nssv3689910, nssv3689825, nssv3757426, nssv3689899, nssv3757410, nssv3689865, nssv3689854, nssv3692798, nssv3757466, nssv3689887, nssv3689905, nssv3757468, nssv3757435, nssv3757459, nssv3757457, nssv3689966, nssv3689847, nssv3689908, nssv3689850, nssv3757460, nssv3692791, nssv3689943, nssv3689868, nssv3689837, nssv3757425, nssv3689827, nssv3689835, nssv3689916, nssv3689820, nssv3757436, nssv3689860, nssv3689849, nssv3689949, nssv3689930, nssv3689944, nssv3689959, nssv3689836, nssv3757474, nssv3689846, nssv3689834, nssv3689823, nssv3692793, nssv3689960, nssv3689924, nssv3689903, nssv3689934, nssv3689935, nssv3757446, nssv3689936, nssv3757438, nssv3757472, nssv3757451, nssv3692789, nssv3689928, nssv3689881, nssv3692796, nssv3689921, nssv3689915, nssv3689958, nssv3689898, nssv3689914, nssv3689828, nssv3757433, nssv3689833, nssv3757420, nssv3757407, nssv3692787, nssv3689869, nssv3757447, nssv3689826, nssv3689938, nssv3689855, nssv3689950, nssv3692794, nssv3757432, nssv3689913, nssv3689945, nssv3689942, nssv3689844, nssv3757465, nssv3757403, nssv3757456, nssv3689841, nssv3757430, nssv3757413, nssv3689927, nssv3689900, nssv3689888, nssv3689817, nssv3757411, nssv3757409, nssv3689866, nssv3689939, nssv3689932

Samples

Known Genes

Method

SNP array

Analysis

Affymetrix SNP array copy number analysis

Platform

Affymetrix SNP Array 6.0

Comments

Reference

Coe_et_al_2014

Pubmed ID

Accession Number(s)

Frequency

Sample Size	11257
Observed Gain	0
Observed Loss	244
Observed Complex	0
Frequency	n/a