A curated catalogue of human genomic structural variation

Variant Details

Variant: nsv1017937

Internal ID

19107154

Landmark

Location Information

Type	Coordinates	Assembly	Other Links
Inner	chr9:61520009..61629677	hg38	UCSC Ensembl
Inner	chr9:44727847..44837515	hg19	UCSC Ensembl
Inner	chr9:44667843..44777511	hg18	UCSC Ensembl

Cytoband

9p11.2

Allele length

Assembly	Allele length
hg38	109669
hg19	109669
hg18	109669

Variant Type

CNV gain+loss

Copy Number

Allele State

Allele Origin

Probe Count

Validation Flag

Merged Status

M

Merged Variants

Supporting Variants

nssv3693529, nssv3693527, nssv3693501, nssv3693459, nssv3760852, nssv3693478, nssv3760879, nssv3692197, nssv3693509, nssv3692334, nssv3692232, nssv3760877, nssv3693486, nssv3692256, nssv3692170, nssv3693517, nssv3692317, nssv3692319, nssv3693515, nssv3760868, nssv3692292, nssv3692205, nssv3693532, nssv3693493, nssv3692286, nssv3760870, nssv3692288, nssv3692229, nssv3760891, nssv3693474, nssv3760909, nssv3693508, nssv3692301, nssv3692225, nssv3692336, nssv3693499, nssv3693464, nssv3692270, nssv3760873, nssv3692283, nssv3692269, nssv3693484, nssv3693467, nssv3693536, nssv3692312, nssv3692310, nssv3692171, nssv3692157, nssv3693528, nssv3692221, nssv3693495, nssv3760892, nssv3693485, nssv3693487, nssv3693452, nssv3692189, nssv3692316, nssv3692262, nssv3760905, nssv3692276, nssv3693457, nssv3692245, nssv3692239, nssv3692228, nssv3693535, nssv3692244, nssv3692223, nssv3692300, nssv3693511, nssv3692208, nssv3692180, nssv3760854, nssv3760878, nssv3692202, nssv3692279, nssv3692278, nssv3692329, nssv3692209, nssv3692274, nssv3760866, nssv3692214, nssv3693488, nssv3693450, nssv3760893, nssv3693490, nssv3692222, nssv3692323, nssv3692273, nssv3692308, nssv3692174, nssv3693477, nssv3692314, nssv3693447, nssv3692165, nssv3692185, nssv3693456, nssv3692167, nssv3693463, nssv3693458, nssv3692296, nssv3692250, nssv3692303, nssv3692198, nssv3693492, nssv3692318, nssv3692268, nssv3692199, nssv3692275, nssv3760904, nssv3693491, nssv3693469, nssv3693533, nssv3692324, nssv3692166, nssv3692158, nssv3692161, nssv3692277, nssv3692206, nssv3760880, nssv3760902, nssv3692284, nssv3692242, nssv3692255, nssv3692216, nssv3692259, nssv3760856, nssv3692186, nssv3760894, nssv3692217, nssv3692282, nssv3760857, nssv3693497, nssv3692220, nssv3693513, nssv3760882, nssv3693454, nssv3692330, nssv3692182, nssv3693468, nssv3692254, nssv3760887, nssv3693462, nssv3693448, nssv3760865, nssv3693449, nssv3760859, nssv3692226, nssv3692162, nssv3692297, nssv3692252, nssv3692313, nssv3692194, nssv3692280, nssv3692238, nssv3692332, nssv3692215, nssv3760889, nssv3693496, nssv3692272, nssv3692257, nssv3692192, nssv3693472, nssv3692169, nssv3760900, nssv3692325, nssv3692302, nssv3692218, nssv3692156, nssv3692271, nssv3692190, nssv3760876, nssv3693518, nssv3693516, nssv3692322, nssv3693465, nssv3692201, nssv3760883, nssv3692230, nssv3692200, nssv3693489, nssv3760855, nssv3692326, nssv3693470, nssv3692227, nssv3760869, nssv3692188, nssv3693483, nssv3692249, nssv3693514, nssv3760863, nssv3692266, nssv3692207, nssv3692176, nssv3692306, nssv3693503, nssv3693502, nssv3692281, nssv3692204, nssv3692253, nssv3692211, nssv3692168, nssv3693525, nssv3693451, nssv3692298, nssv3693481, nssv3760871, nssv3692231, nssv3760885, nssv3760884, nssv3692315, nssv3692235, nssv3692181, nssv3760872, nssv3692196, nssv3692193, nssv3692290, nssv3692187, nssv3760906, nssv3692248, nssv3693523, nssv3693460, nssv3693471, nssv3692289, nssv3692219, nssv3692335, nssv3760901, nssv3693534, nssv3693453, nssv3692307, nssv3692241, nssv3760862, nssv3693455, nssv3760898, nssv3693531, nssv3693510, nssv3692331, nssv3692159, nssv3693505, nssv3692311, nssv3693512, nssv3692321, nssv3692337, nssv3760881, nssv3692246, nssv3692237, nssv3760875, nssv3692304, nssv3693461, nssv3693522, nssv3760897, nssv3692285, nssv3692294, nssv3692233, nssv3760874, nssv3692203, nssv3692263, nssv3692172, nssv3692293, nssv3692305, nssv3692195, nssv3692178, nssv3760895, nssv3692264, nssv3692179, nssv3692240, nssv3693530, nssv3693480, nssv3692333, nssv3692251, nssv3693520, nssv3693475, nssv3692160, nssv3693476, nssv3692224, nssv3693482, nssv3692183, nssv3692177, nssv3760864, nssv3693473, nssv3693521, nssv3760858, nssv3760867, nssv3693506, nssv3692261, nssv3692213, nssv3692191, nssv3760890, nssv3693494, nssv3760886, nssv3692291, nssv3692338, nssv3760861, nssv3692164, nssv3692173, nssv3692236, nssv3692175, nssv3692265, nssv3692210, nssv3692327, nssv3760907, nssv3693466, nssv3693500, nssv3692247, nssv3693504, nssv3760899, nssv3692339, nssv3693507, nssv3760903, nssv3693524, nssv3693479, nssv3692243, nssv3692287, nssv3692320, nssv3760860, nssv3692212, nssv3692328, nssv3692258, nssv3760888, nssv3692163, nssv3693519, nssv3692309, nssv3693498, nssv3692234, nssv3760853, nssv3693526, nssv3692295, nssv3692299, nssv3692267, nssv3760908, nssv3760896, nssv3692184, nssv3692260

Samples

Known Genes

Method

SNP array

Analysis

Affymetrix SNP array copy number analysis

Platform

Affymetrix SNP Array 6.0

Comments

Reference

Coe_et_al_2014

Pubmed ID

Accession Number(s)

Frequency

Sample Size	11257
Observed Gain	205
Observed Loss	127
Observed Complex	0
Frequency	n/a