A curated catalogue of human genomic structural variation




Variant Details

Variant: nsv1011529



Internal ID19100746
Landmark
Location Information
TypeCoordinatesAssemblyOther Links
Innerchr1:196769481..196843388hg38UCSC Ensembl
Innerchr1:196738611..196812518hg19UCSC Ensembl
Innerchr1:195005234..195079141hg18UCSC Ensembl
Cytoband1q31.3
Allele length
AssemblyAllele length
hg3873908
hg1973908
hg1873908
Variant TypeCNV gain+loss
Copy Number
Allele State
Allele Origin
Probe Count
Validation Flag
Merged StatusM
Merged Variantsdgv526n100
Supporting Variantsnssv3496354, nssv3483430, nssv3482952, nssv3483208, nssv3496548, nssv3486777, nssv3483034, nssv3494224, nssv3485216, nssv3500875, nssv3705378, nssv3705336, nssv3497748, nssv3502163, nssv3490824, nssv3705338, nssv3485477, nssv3486129, nssv3501064, nssv3502410, nssv3486061, nssv3497566, nssv3497483, nssv3489689, nssv3482873, nssv3499014, nssv3492635, nssv3495329, nssv3498959, nssv3501063, nssv3494607, nssv3496168, nssv3493293, nssv3500959, nssv3496802, nssv3494380, nssv3496870, nssv3492715, nssv3501557, nssv3485091, nssv3488286, nssv3705352, nssv3705372, nssv3705347, nssv3485637, nssv3497952, nssv3705351, nssv3492955, nssv3489902, nssv3493606, nssv3495191, nssv3491066, nssv3489111, nssv3488798, nssv3486267, nssv3499485, nssv3705359, nssv3495530, nssv3705354, nssv3705376, nssv3497625, nssv3493460, nssv3493145, nssv3500053, nssv3488894, nssv3488564, nssv3486111, nssv3485579, nssv3497584, nssv3499502, nssv3497304, nssv3489831, nssv3502152, nssv3502285, nssv3705335, 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Samples
Known GenesCFHR1, CFHR3
MethodSNP array
AnalysisAffymetrix SNP array copy number analysis
PlatformAffymetrix SNP Array 6.0
Comments
ReferenceCoe_et_al_2014
Pubmed ID25217958
Accession Number(s)nsv1011529
Frequency
Sample Size11257
Observed Gain288
Observed Loss162
Observed Complex0
Frequencyn/a


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