A curated catalogue of human genomic structural variation

Variant Details

Variant: esv3892006

Internal ID

18839716

Landmark

Location Information

Type	Coordinates	Assembly	Other Links
Inner	chr11:55623755..55674892	hg38	UCSC Ensembl
Outer	chr11:55600413..55685447	hg38	UCSC Ensembl
Inner	chr11:55391231..55442368	hg19	UCSC Ensembl
Outer	chr11:55367889..55452923	hg19	UCSC Ensembl
Inner	chr11:55147807..55198944	hg18	UCSC Ensembl
Outer	chr11:55124465..55209499	hg18	UCSC Ensembl

Cytoband

11q11

Allele length

Assembly	Allele length
hg38	85035
hg19	85035
hg18	85035

Variant Type

CNV gain+loss

Copy Number

Allele State

Allele Origin

Probe Count

Validation Flag

Merged Status

M

Merged Variants

Supporting Variants

essv25795903, essv25787114, essv25796014, essv25794001, essv25794802, essv25799999, essv25795201, essv25781747, essv25794952, essv25785047, essv25795022, essv25788669, essv25795722, essv25800593, essv25795689, essv25796237, essv25797026, essv25781891, essv25795100, essv25785680, essv25793365, essv25784224, essv25800014, essv25781202, essv25790069, essv25790147, essv25789068, essv25795616, essv25790769, essv25794843, essv25796970, essv25794174, essv25793321, essv25782602, essv25795479, essv25795704, essv25780413, essv25792736, essv25795940, essv25795743, essv25800045, essv25779069, essv25778225, essv25793702, essv25794102, essv25793620, essv25794295, essv25794055, essv25793654, essv25783342, essv25794527, essv25794033, essv25790225, essv25784502, essv25795497, essv25778281, essv25794558, essv25793298, essv25794653, essv25790880, essv25786335, essv25794077, essv25794140, essv25798347, essv25787335, essv25780126, essv25794051, essv25794903, essv25782113, essv25783936, essv25793807, 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Samples

Known Genes

OR4C11, OR4C6, OR4P4, OR4S2

Method

SNP array

Analysis

Platform

Illumina HumanHap 610
Illumina Human OmniExpress

Comments

Reference

Suktitipat_et_al_2014

Pubmed ID

Accession Number(s)

Frequency

Sample Size	3017
Observed Gain	4
Observed Loss	481
Observed Complex	0
Frequency	n/a