A curated catalogue of human genomic structural variation




Variant Details

Variant: esv3892006



Internal ID18839716
Landmark
Location Information
TypeCoordinatesAssemblyOther Links
Innerchr11:55623755..55674892hg38UCSC Ensembl
Outerchr11:55600413..55685447hg38UCSC Ensembl
Innerchr11:55391231..55442368hg19UCSC Ensembl
Outerchr11:55367889..55452923hg19UCSC Ensembl
Innerchr11:55147807..55198944hg18UCSC Ensembl
Outerchr11:55124465..55209499hg18UCSC Ensembl
Cytoband11q11
Allele length
AssemblyAllele length
hg3885035
hg1985035
hg1885035
Variant TypeCNV gain+loss
Copy Number
Allele State
Allele Origin
Probe Count
Validation Flag
Merged StatusM
Merged Variants
Supporting Variantsessv25795903, essv25787114, essv25796014, essv25794001, essv25794802, essv25799999, essv25795201, essv25781747, essv25794952, essv25785047, essv25795022, essv25788669, essv25795722, essv25800593, essv25795689, essv25796237, essv25797026, essv25781891, essv25795100, essv25785680, essv25793365, essv25784224, essv25800014, essv25781202, essv25790069, essv25790147, essv25789068, essv25795616, essv25790769, essv25794843, essv25796970, essv25794174, essv25793321, essv25782602, essv25795479, essv25795704, essv25780413, essv25792736, essv25795940, essv25795743, essv25800045, essv25779069, essv25778225, essv25793702, essv25794102, essv25793620, essv25794295, essv25794055, essv25793654, essv25783342, essv25794527, essv25794033, essv25790225, essv25784502, essv25795497, essv25778281, essv25794558, essv25793298, essv25794653, essv25790880, essv25786335, essv25794077, essv25794140, essv25798347, essv25787335, essv25780126, essv25794051, essv25794903, essv25782113, essv25783936, essv25793807, essv25799903, essv25796092, essv25787557, essv25781446, essv25793891, essv25794404, essv25793903, essv25793832, essv25793792, essv25791191, essv25796160, essv25796570, essv25795126, essv25794313, essv25792792, essv25789530, essv25793927, essv25799537, essv25793383, essv25795846, essv25794489, essv25783036, essv25795360, essv25801536, essv25782609, essv25795674, essv25785113, essv25795848, essv25795294, essv25795104, essv25787224, essv25801014, essv25793996, essv25793859, essv25794154, essv25796781, essv25795080, essv25795465, essv25793628, essv25789335, essv25795057, essv25794618, essv25788779, essv25782513, essv25781524, essv25794941, essv25796459, essv25782036, essv25794641, essv25793987, essv25795801, essv25786413, essv25795383, essv25794752, essv25787113, essv25794959, essv25794347, essv25780224, essv25795406, essv25794747, essv25785336, essv25799648, essv25795502, essv25793359, essv25788482, essv25794261, essv25793895, essv25794646, essv25793695, essv25784680, essv25793237, essv25797103, essv25783646, essv25795625, essv25794479, essv25785924, essv25795320, essv25779280, essv25797393, essv25783335, essv25794390, essv25796837, essv25778447, essv25789814, essv25794778, essv25795881, essv25795309, essv25798570, essv25789605, essv25794879, essv25793764, essv25779980, essv25793292, essv25795648, essv25786113, essv25795798, essv25789903, essv25786902, essv25800159, essv25800804, essv25793581, essv25787112, essv25794598, essv25786669, essv25789647, essv25787558, essv25793254, essv25793330, essv25793497, essv25794538, essv25795461, essv25778224, essv25793409, essv25795074, essv25780025, essv25793756, essv25781780, essv25794449, essv25782936, essv25795136, essv25794248, essv25795645, essv25793689, essv25801181, essv25799458, essv25800236, essv25795838, essv25795456, essv25795334, essv25800392, essv25795550, essv25798770, essv25793223, essv25800125, essv25797337, essv25793314, essv25793942, essv25784557, essv25793565, essv25783458, essv25795376, essv25789497, essv25780202, essv25794799, essv25801569, essv25795535, essv25799471, essv25785358, essv25793488, essv25800281, essv25795749, essv25794943, essv25789503, essv25794194, essv25793003, essv25793904, essv25797237, essv25794575, essv25778392, essv25793543, essv25783424, essv25784558, essv25785735, essv25778780, essv25794894, essv25792191, essv25779769, essv25781036, essv25794859, essv25786380, essv25794521, essv25798792, essv25798314, essv25794452, essv25794584, essv25793777, essv25791869, essv25800340, essv25795736, essv25792858, essv25795531, essv25786324, essv25793943, essv25799137, essv25798526, essv25785890, essv25784341, essv25793480, essv25793874, essv25800693, essv25798426, essv25794868, essv25785721, essv25793923, essv25786002, essv25795197, essv25794820, essv25787197, essv25801403, essv25794445, essv25793674, essv25794015, essv25783302, essv25795143, essv25794237, essv25790847, essv25799682, essv25795146, essv25785469, essv25794090, essv25786001, essv25781557, essv25794564, essv25779558, essv25794361, essv25795933, essv25795481, essv25795260, essv25793681, essv25781435, essv25793218, essv25793618, essv25795027, essv25780335, essv25797125, essv25787090, essv25793136, essv25783269, essv25795661, essv25780726, essv25794485, essv25792580, essv25783391, essv25782668, essv25794523, essv25794061, essv25785335, essv25781335, essv25782862, essv25783613, essv25793786, essv25795520, essv25780339, essv25793658, essv25786557, essv25795609, essv25794680, essv25793729, essv25793467, essv25794817, essv25791025, essv25793278, essv25794120, essv25784335, essv25797236, essv25786213, essv25795124, essv25778558, essv25782780, essv25794039, essv25801458, essv25786224, essv25794681, essv25793520, essv25795223, essv25794282, essv25781599, essv25782002, essv25780147, essv25795174, essv25795326, essv25783557, essv25792180, essv25783113, essv25794109, essv25788780, essv25795237, essv25785158, essv25790313, essv25801425, essv25790647, essv25794971, essv25794621, essv25794623, essv25797715, essv25780269, essv25793652, essv25794567, essv25793980, essv25793282, essv25780447, essv25799125, essv25795756, essv25793530, essv25795517, essv25793554, essv25794091, essv25790980, essv25793288, essv25780002, essv25794798, essv25794442, essv25778226, essv25795918, essv25793776, essv25793256, essv25794136, essv25782736, essv25786019, essv25800681, essv25779447, essv25795593, essv25784724, essv25798737, essv25797570, essv25797348, essv25795267, essv25790446, essv25795348, essv25780446, essv25793984, essv25798348, essv25787013, essv25794126, essv25784114, essv25795868, essv25783508, essv25794792, essv25798915, essv25793407, essv25795621, essv25795682, essv25783647, essv25781113, essv25781658, essv25785990, essv25778425, essv25787757, essv25790158, essv25800569, essv25794932, essv25794338, essv25781291, essv25793277, essv25781003, essv25793431, essv25790447, essv25794423, essv25785780, essv25788546, essv25783224, essv25778536, essv25780747, essv25797792, essv25799570, essv25794186, essv25781324, essv25780669, essv25793179, essv25779113, essv25786358, essv25795190, essv25794070, essv25796249, essv25795788, essv25793511, essv25793790, essv25796126, essv25799347, essv25795581, essv25793866, essv25795566, essv25793523, essv25779336, essv25794945, essv25787946, essv25800637, essv25792102, essv25794345, essv25792825, essv25794593, essv25788057, essv25783546, essv25796348, essv25795160, essv25779337, essv25794586, essv25794259, essv25784891, essv25797848, essv25782213, essv25794905, essv25793686, essv25793750, essv25799325, essv25794678, essv25793868, essv25781491, essv25800792, essv25795431, essv25794263, essv25794883, essv25794835, essv25781224, essv25778336, essv25799593, essv25778669, essv25783494, essv25794096, essv25794071, essv25796003, essv25793491, essv25796127, essv25795090
Samples
Known GenesOR4C11, OR4C6, OR4P4, OR4S2
MethodSNP array
Analysis
PlatformIllumina HumanHap 610
Illumina Human OmniExpress
Comments
ReferenceSuktitipat_et_al_2014
Pubmed ID25118596
Accession Number(s)esv3892006
Frequency
Sample Size3017
Observed Gain4
Observed Loss481
Observed Complex0
Frequencyn/a


Hosted by The Centre for Applied Genomics
Grant support for DGV
Please read the usage disclaimer