A curated catalogue of human genomic structural variation

Variant Details

Variant: esv3890830

Internal ID

19185132

Landmark

Location Information

Type	Coordinates	Assembly	Other Links
Inner	chr6:32491715..32508838	hg38	UCSC Ensembl
Outer	chr6:32484256..32517715	hg38	UCSC Ensembl
Inner	chr6:32459492..32476615	hg19	UCSC Ensembl
Outer	chr6:32452033..32485492	hg19	UCSC Ensembl
Inner	chr6:32567470..32584593	hg18	UCSC Ensembl
Outer	chr6:32560011..32593470	hg18	UCSC Ensembl

Cytoband

6p21.32

Allele length

Assembly	Allele length
hg38	33460
hg19	33460
hg18	33460

Variant Type

CNV gain+loss

Copy Number

Allele State

Allele Origin

Probe Count

Validation Flag

Merged Status

M

Merged Variants

Supporting Variants

essv25793842, essv25791681, essv25790136, essv25793677, essv25795842, essv25788302, essv25793200, essv25795043, essv25789582, essv25795493, essv25788762, essv25797659, essv25794922, essv25794500, essv25794005, essv25791335, essv25785802, essv25781869, essv25795232, essv25794580, essv25789604, essv25794660, essv25794662, essv25795954, essv25789201, essv25795785, essv25793725, essv25782480, essv25798593, essv25795591, essv25794647, essv25788811, essv25790758, essv25793771, essv25790435, essv25794751, essv25795478, essv25789257, essv25797504, essv25794913, essv25793475, essv25794210, essv25795816, essv25794506, essv25793430, essv25787269, essv25790335, essv25795945, essv25789402, essv25787635, essv25790514, essv25793879, essv25793333, essv25793319, essv25794994, essv25795422, essv25789590, essv25793707, essv25793345, essv25793839, essv25789636, essv25791291, essv25794583, essv25790681, essv25794359, essv25794191, essv25793641, essv25791603, essv25791324, essv25793284, essv25795414, essv25784169, essv25793456, essv25791391, essv25799126, essv25780369, essv25791936, essv25794378, essv25788913, essv25793246, essv25801470, essv25795787, essv25794289, essv25791892, essv25794228, essv25779414, essv25801303, essv25794119, essv25790492, essv25787657, essv25793589, essv25789446, essv25793899, essv25794708, essv25793167, essv25793095, essv25796382, essv25783380, essv25794989, essv25794814, essv25793276, essv25793967, essv25794024, essv25787302, essv25795417, essv25794381, essv25784925, essv25782880, essv25791958, essv25798270, essv25795001, essv25795132, essv25788467, essv25790914, essv25794573, essv25794386, essv25794029, essv25793863, essv25794185, essv25789947, essv25789443, essv25789191, essv25793085, essv25788857, essv25793953, essv25794187, essv25797981, essv25794577, essv25788513, essv25788201, essv25791158, essv25796948, essv25801658, essv25793337, essv25794677, essv25793460, essv25793796, essv25785524, essv25795851, essv25793788, essv25790714, essv25798148, essv25789563, essv25795895, essv25794969, essv25794277, essv25794211, essv25793082, essv25793414, essv25793392, essv25795901, essv25791147, essv25794008, essv25796815, essv25794732, essv25792914, essv25794982, essv25793114, essv25795907, essv25798214, essv25795349, essv25793683, essv25789312, essv25783258, essv25793406, essv25793418, essv25793210, essv25793275, essv25793920, essv25793387, essv25794947, essv25792725, essv25795491, essv25794083, essv25789135, essv25795934, essv25789168, essv25794550, essv25789980, essv25778381, essv25794257, essv25793187, essv25796693, essv25795808, essv25795769, essv25795396, essv25793325, essv25789581, essv25789092, essv25788236, essv25792535, essv25793369, essv25794326, essv25795443, essv25794691, essv25793329, essv25786558, essv25783958, essv25795806, essv25794925, essv25792036, essv25789233, essv25795776, essv25787913, essv25794331, essv25794596, essv25797059, essv25794919, essv25791447, essv25794152, essv25793671, essv25794628, essv25792091, essv25790958, essv25794530, essv25797537, essv25794864, essv25793182, essv25795091, essv25794850, essv25794447, essv25793806, essv25794688, essv25793841, essv25793532, essv25793941, essv25780514, essv25793883, essv25786247, essv25794553, essv25780047, essv25793766, essv25795507, essv25795764, essv25793403, essv25792847, essv25789113, essv25794664, essv25794790, essv25795346, essv25794620, essv25794819, essv25790269, essv25795970, essv25793443, essv25793906, essv25794520, essv25788135, essv25794757, essv25783114, essv25791125, essv25793393, essv25788460, essv25794222, essv25795733, essv25795752, essv25793817, essv25794059, essv25793605, essv25795887, essv25788824, essv25794797, essv25790614, essv25794502, essv25793206, essv25791546, essv25791636, essv25789035

Samples

Known Genes

Method

SNP array

Analysis

Platform

Illumina HumanHap 610

Comments

Reference

Suktitipat_et_al_2014

Pubmed ID

Accession Number(s)

Frequency

Sample Size	3017
Observed Gain	18
Observed Loss	250
Observed Complex	0
Frequency	n/a