Variant Details

Variant: esv3603841

Internal ID

6990872

Landmark

Location Information

Type	Coordinates	Assembly	Other Links
	chr5:2819289..2821143	hg38	UCSC Ensembl
Inner	chr5:2819290..2821143	hg38	UCSC Ensembl
Outer	chr5:2819289..2821144	hg38	UCSC Ensembl
	chr5:2819403..2821257	hg19	UCSC Ensembl
Inner	chr5:2819404..2821257	hg19	UCSC Ensembl
Outer	chr5:2819403..2821258	hg19	UCSC Ensembl

Cytoband

5p15.33

Allele length

Assembly	Allele length
hg38	1855
hg19	1855

Variant Type

CNV loss

Copy Number

Allele State

Allele Origin

Probe Count

Validation Flag

Merged Status

Merged Variants

Supporting Variants

essv11790360, essv11790394, essv11790372, essv11790374, essv11790358, essv11790429, essv11790427, essv11790376, essv11790402, essv11790405, essv11790438, essv11790344, essv11790339, essv11790386, essv11790403, essv11790343, essv11790434, essv11790437, essv11790416, essv11790370, essv11790367, essv11790368, essv11790426, essv11790406, essv11790425, essv11790397, essv11790436, essv11790378, essv11790407, essv11790417, essv11790393, essv11790346, essv11790373, essv11790369, essv11790431, essv11790345, essv11790351, essv11790388, essv11790440, essv11790419, essv11790364, essv11790355, essv11790428, essv11790392, essv11790347, essv11790409, essv11790359, essv11790384, essv11790410, essv11790371, essv11790365, essv11790340, essv11790400, essv11790391, essv11790433, essv11790387, essv11790439, essv11790442, essv11790354, essv11790389, essv11790423, essv11790404, essv11790413, essv11790414, essv11790399, essv11790379, essv11790383, essv11790444, essv11790381, essv11790401, essv11790352, essv11790421, essv11790395, essv11790350, essv11790377, essv11790408, essv11790390, essv11790398, essv11790435, essv11790363, essv11790356, essv11790349, essv11790353, essv11790420, essv11790385, essv11790380, essv11790415, essv11790357, essv11790411, essv11790382, essv11790375, essv11790441, essv11790348, essv11790418, essv11790422, essv11790361, essv11790430, essv11790424, essv11790412, essv11790366, essv11790432, essv11790341, essv11790396, essv11790443, essv11790362, essv11790342

Samples

HG03096, HG02574, NA19701, NA19141, HG03366, NA19700, HG03484, HG02628, NA19914, HG03175, HG01079, NA19704, NA18917, NA18878, HG03100, HG03295, HG03139, HG02888, NA19190, NA19446, HG03099, HG03091, HG02860, HG02854, HG02645, NA19138, HG03224, NA19384, HG01067, HG03212, HG02571, NA19901, NA18520, HG03225, NA19239, NA19209, NA19456, HG03055, HG03114, HG02715, HG03270, HG02819, HG02442, HG03120, HG03160, NA19707, HG03061, NA18934, NA18933, HG02322, NA18516, NA19982, HG03428, HG02953, HG01989, NA20126, HG03159, HG02508, HG02968, HG03027, HG02537, HG03294, HG03123, HG03301, NA19461, NA19114, HG03382, HG02817, HG03388, HG03451, HG02256, HG01890, NA19318, NA19095, HG02896, HG02675, HG02255, HG03461, NA19454, HG02611, NA19334, HG03259, HG03473, NA19323, NA19143, HG01086, NA18501, HG03565, HG03432, NA19248, HG02095, NA19351, NA20334, HG02107, NA18873, NA19116, NA19213, HG03401, NA19030, HG01431, HG02465, HG02425, HG03072, NA18511, HG02643, HG01191

Known Genes

Method

Sequencing

Analysis

Platform

Multiple platforms

Comments

Reference

1000_Genomes_Consortium_Phase_3

Pubmed ID

21293372

Accession Number(s)

esv3603841

Frequency

Sample Size	2504
Observed Gain	0
Observed Loss	106
Observed Complex	0
Frequency	n/a