A curated catalogue of human genomic structural variation




Variant Details

Variant: esv3603713



Internal ID6990744
Landmark
Location Information
TypeCoordinatesAssemblyOther Links
chr5:11566..20618hg38UCSC Ensembl
Innerchr5:12066..20118hg38UCSC Ensembl
Outerchr5:10566..21618hg38UCSC Ensembl
chr5:11566..20618hg19UCSC Ensembl
Innerchr5:12066..20118hg19UCSC Ensembl
Outerchr5:10566..21618hg19UCSC Ensembl
Cytoband5p15.33
Allele length
AssemblyAllele length
hg389053
hg199053
Variant TypeCNV loss
Copy Number
Allele State
Allele Origin
Probe Count
Validation Flag
Merged StatusM
Merged Variants
Supporting Variantsessv11764787, essv11764749, essv11764745, essv11764797, essv11764788, essv11764726, essv11764791, essv11764795, essv11764744, essv11764813, essv11764768, essv11764711, essv11764718, essv11764777, essv11764807, essv11764746, essv11764781, essv11764727, essv11764725, essv11764722, essv11764715, essv11764773, essv11764809, essv11764754, essv11764748, essv11764775, essv11764803, essv11764736, essv11764755, essv11764706, essv11764732, essv11764719, essv11764716, essv11764780, essv11764776, essv11764792, essv11764802, essv11764724, essv11764794, essv11764770, essv11764783, essv11764782, essv11764747, essv11764811, essv11764735, essv11764717, essv11764800, essv11764714, essv11764814, essv11764731, essv11764708, essv11764763, essv11764789, essv11764760, essv11764774, essv11764790, essv11764778, essv11764810, essv11764769, essv11764721, essv11764758, essv11764720, essv11764741, essv11764750, essv11764709, essv11764742, essv11764812, essv11764743, essv11764779, essv11764723, essv11764796, essv11764756, essv11764738, essv11764806, essv11764730, essv11764784, essv11764767, essv11764733, essv11764740, essv11764752, essv11764805, essv11764793, essv11764808, essv11764713, essv11764710, essv11764786, essv11764772, essv11764785, essv11764804, essv11764761, essv11764764, essv11764739, essv11764766, essv11764751, essv11764759, essv11764815, essv11764799, essv11764707, essv11764798, essv11764765, essv11764728, essv11764757, essv11764753, essv11764762, essv11764771, essv11764712, essv11764737, essv11764801, essv11764734, essv11764729
SamplesHG02614, HG00114, HG02890, NA19648, HG02610, HG00121, HG00143, NA19909, HG00102, HG01624, HG01443, NA11995, HG03960, NA12814, HG01052, HG01537, HG01079, NA12843, HG02852, HG01389, HG00103, HG01531, HG00364, NA12340, NA12399, NA12813, HG00641, HG00109, HG03722, HG01064, NA19678, HG01710, HG03246, HG00346, HG01083, HG03629, HG01510, HG00334, HG01110, HG04033, NA12275, HG02003, NA20775, HG00325, HG00232, HG03888, HG01369, HG01673, HG02427, HG01626, HG00326, HG00323, HG00137, HG00188, HG00176, NA20505, HG00190, HG00344, HG01607, HG00551, HG01049, HG01615, HG01311, HG01619, HG01762, HG00373, NA11893, HG03024, HG03745, HG01705, HG00276, HG02585, HG01680, HG01286, NA12546, HG01204, HG00376, HG01530, HG02684, HG00375, HG03117, NA20520, NA20527, HG00308, HG00237, NA20544, NA07037, HG01991, HG00339, NA21125, HG01395, HG00111, HG03789, HG02238, NA20582, HG02646, HG03022, HG00310, NA19770, HG00280, HG03077, HG01468, HG00343, HG00274, HG00252, HG01617, HG01775, HG03815, HG01061, NA20511
Known Genes
MethodSequencing
Analysis
PlatformMultiple platforms
Comments
Reference1000_Genomes_Consortium_Phase_3
Pubmed ID21293372
Accession Number(s)esv3603713
Frequency
Sample Size2504
Observed Gain0
Observed Loss110
Observed Complex0
Frequencyn/a


Hosted by The Centre for Applied Genomics
Grant support for DGV
Please read the usage disclaimer