Variant Details

Variant: esv3603466

Internal ID

6643720

Landmark

Location Information

Type	Coordinates	Assembly	Other Links
	chr4:184706906..184707423	hg38	UCSC Ensembl
Inner	chr4:184706911..184707419	hg38	UCSC Ensembl
Outer	chr4:184706902..184707428	hg38	UCSC Ensembl
	chr4:185628060..185628577	hg19	UCSC Ensembl
Inner	chr4:185628065..185628573	hg19	UCSC Ensembl
Outer	chr4:185628056..185628582	hg19	UCSC Ensembl

Cytoband

4q35.1

Allele length

Assembly	Allele length
hg38	518
hg19	518

Variant Type

CNV loss

Copy Number

Allele State

Allele Origin

Probe Count

Validation Flag

Merged Status

Merged Variants

Supporting Variants

essv11733541, essv11733545, essv11733536, essv11733480, essv11733473, essv11733485, essv11733454, essv11733475, essv11733449, essv11733436, essv11733451, essv11733527, essv11733440, essv11733466, essv11733448, essv11733456, essv11733481, essv11733469, essv11733470, essv11733488, essv11733502, essv11733538, essv11733515, essv11733434, essv11733487, essv11733540, essv11733504, essv11733477, essv11733539, essv11733464, essv11733517, essv11733520, essv11733547, essv11733526, essv11733441, essv11733472, essv11733532, essv11733508, essv11733531, essv11733522, essv11733521, essv11733458, essv11733552, essv11733467, essv11733439, essv11733478, essv11733537, essv11733499, essv11733494, essv11733543, essv11733486, essv11733462, essv11733438, essv11733516, essv11733533, essv11733465, essv11733550, essv11733501, essv11733479, essv11733518, essv11733492, essv11733457, essv11733497, essv11733524, essv11733489, essv11733435, essv11733551, essv11733468, essv11733496, essv11733505, essv11733514, essv11733498, essv11733432, essv11733453, essv11733495, essv11733535, essv11733445, essv11733443, essv11733503, essv11733474, essv11733529, essv11733511, essv11733491, essv11733530, essv11733493, essv11733484, essv11733461, essv11733510, essv11733507, essv11733482, essv11733548, essv11733471, essv11733483, essv11733433, essv11733549, essv11733463, essv11733513, essv11733476, essv11733460, essv11733523, essv11733519, essv11733509, essv11733500, essv11733528, essv11733506, essv11733446, essv11733437, essv11733544, essv11733459, essv11733452, essv11733444, essv11733442, essv11733525, essv11733512, essv11733490, essv11733534, essv11733450, essv11733447, essv11733546, essv11733542, essv11733455

Samples

HG03514, HG01986, HG01985, NA19141, HG03366, NA19909, HG03548, HG03163, HG03449, NA18877, HG03115, HG02891, HG02804, NA19355, NA19819, NA19393, HG03139, HG03577, HG03172, NA19314, NA20359, HG03199, NA19374, HG03133, NA18519, HG03086, HG03099, NA19764, HG03499, NA19448, HG02485, NA19119, HG02549, NA18916, HG02854, HG03105, NA19457, HG02816, NA19130, HG02489, HG02461, NA19372, HG03045, NA19235, HG02420, HG03352, NA18520, HG02946, HG03267, NA19209, HG02715, HG03369, NA19451, NA19200, NA19027, NA18638, HG02009, HG02442, HG02820, NA19247, HG03054, HG03363, HG02236, NA18933, HG02057, NA19391, HG02953, HG02887, HG01142, HG03575, NA18871, HG02497, HG03124, HG03294, HG01390, HG01047, HG01094, HG03301, HG02817, NA18856, NA18912, HG03571, NA19257, HG02256, NA19160, HG02896, HG01990, HG02484, HG02722, HG03064, HG02255, NA19401, NA19308, HG02330, HG02807, NA19390, NA19321, HG03461, NA19149, HG02501, NA19454, NA20351, NA19144, HG03259, HG02982, HG03433, NA19467, HG03103, HG02771, NA19143, NA19223, HG02646, HG03410, NA18876, HG03162, HG02947, HG03198, HG02643, HG03303, HG03166, HG03265

Known Genes

CENPU

Method

Sequencing

Analysis

Platform

Multiple platforms

Comments

Reference

1000_Genomes_Consortium_Phase_3

Pubmed ID

21293372

Accession Number(s)

esv3603466

Frequency

Sample Size	2504
Observed Gain	0
Observed Loss	121
Observed Complex	0
Frequency	n/a