Variant Details

Variant: esv3603426

Internal ID

6990457

Landmark

Location Information

Type	Coordinates	Assembly	Other Links
	chr4:182648852..182650845	hg38	UCSC Ensembl
Inner	chr4:182648852..182650845	hg38	UCSC Ensembl
Outer	chr4:182648811..182650998	hg38	UCSC Ensembl
	chr4:183570005..183571998	hg19	UCSC Ensembl
Inner	chr4:183570005..183571998	hg19	UCSC Ensembl
Outer	chr4:183569964..183572151	hg19	UCSC Ensembl

Cytoband

4q35.1

Allele length

Assembly	Allele length
hg38	1994
hg19	1994

Variant Type

CNV loss

Copy Number

Allele State

Allele Origin

Probe Count

Validation Flag

Merged Status

Merged Variants

Supporting Variants

essv11731916, essv11732071, essv11731919, essv11732230, essv11732194, essv11732038, essv11732049, essv11732110, essv11731946, essv11732227, essv11732117, essv11732051, essv11732027, essv11732161, essv11731967, essv11732182, essv11731991, essv11731961, essv11732106, essv11732048, essv11731979, essv11731986, essv11732235, essv11732136, essv11731891, essv11732006, essv11731889, essv11732025, essv11731914, essv11731881, essv11732021, essv11731993, essv11732003, essv11731856, essv11731879, essv11731939, essv11731937, essv11731970, essv11732085, essv11732170, essv11731886, essv11732075, essv11732185, essv11732013, essv11732181, essv11731938, essv11731952, essv11732107, essv11731900, essv11732040, essv11732206, essv11731913, essv11732231, essv11732039, essv11732139, essv11731854, essv11732177, essv11732069, essv11732041, essv11732057, essv11732108, essv11731945, essv11732067, essv11731982, essv11732226, essv11731923, essv11731915, essv11731980, essv11732120, essv11732201, essv11731940, essv11731922, essv11732208, essv11732166, essv11732002, essv11732030, essv11732033, essv11732010, essv11731887, essv11731880, essv11732094, essv11731901, essv11731882, essv11732026, essv11732072, essv11732157, essv11731908, essv11732160, essv11731962, essv11731871, essv11732020, essv11732189, essv11732024, essv11731975, essv11731905, essv11731920, essv11731861, essv11732113, essv11732214, essv11732134, essv11731992, essv11731987, essv11732014, essv11732236, essv11732068, essv11731906, essv11732202, essv11732229, essv11732104, essv11731867, essv11731959, essv11731894, essv11732153, essv11732093, essv11732172, essv11732223, essv11732098, essv11731857, essv11732175, essv11732148, essv11731897, essv11732158, essv11731960, essv11731903, essv11732174, essv11732151, essv11732125, essv11731883, essv11731954, essv11732053, essv11731929, essv11732046, essv11732074, essv11732128, essv11732102, essv11732031, essv11732015, essv11731964, essv11731862, essv11732131, essv11732082, essv11732022, essv11732086, essv11732037, essv11732154, essv11732116, essv11732055, essv11731999, essv11731853, essv11731968, essv11732096, essv11732070, essv11732192, essv11731917, essv11731948, essv11731874, essv11732141, essv11731983, essv11732130, essv11732237, essv11732101, essv11731949, essv11732050, essv11732215, essv11731974, essv11732126, essv11732220, essv11731863, essv11732190, essv11732084, essv11732059, essv11731965, essv11732186, essv11732032, essv11732149, essv11732054, essv11732129, essv11732228, essv11731969, essv11732118, essv11732238, essv11732145, essv11731873, essv11732097, essv11732147, essv11732173, essv11731858, essv11732099, essv11732047, essv11731958, essv11732019, essv11731977, essv11732105, essv11732028, essv11731895, essv11732017, essv11732018, essv11732205, essv11732115, essv11731966, essv11732137, essv11731902, essv11731911, essv11732143, essv11732034, essv11732168, essv11732156, essv11731872, essv11732005, essv11731924, essv11732232, essv11732090, essv11732009, essv11732187, essv11732095, essv11731860, essv11731855, essv11732209, essv11731978, essv11732221, essv11732222, essv11732111, essv11732196, essv11731990, essv11732216, essv11732073, essv11731896, essv11732080, essv11732218, essv11732163, essv11731890, essv11731870, essv11731859, essv11731926, essv11731866, essv11732162, essv11731953, essv11731921, essv11732140, essv11731994, essv11732001, essv11731931, essv11732197, essv11732103, essv11732058, essv11731956, essv11732164, essv11732008, essv11732000, essv11732219, essv11732207, essv11731955, essv11732078, essv11731885, essv11732124, essv11732066, essv11731985, essv11731927, essv11731884, essv11732087, essv11731888, essv11731950, essv11732167, essv11732065, essv11732122, essv11731912, essv11732213, essv11732200, essv11732159, essv11732195, essv11732150, essv11731868, essv11732133, essv11732146, essv11731995, essv11732114, essv11731935, essv11731898, essv11732142, essv11732212, essv11732198, essv11732109, essv11731971, essv11731998, essv11731918, essv11732180, essv11732225, essv11731963, essv11732176, essv11731989, essv11732203, essv11732138, essv11731981, essv11732217, essv11731947, essv11731972, essv11731869, essv11731973, essv11732204, essv11732210, essv11732035, essv11731876, essv11732044, essv11732184, essv11731909, essv11732193, essv11732135, essv11731877, essv11732155, essv11731944, essv11731904, essv11732119, essv11731997, essv11731878, essv11732179, essv11732171, essv11732076, essv11731996, essv11731942, essv11731928, essv11731899, essv11731907, essv11732165, essv11731957, essv11732063, essv11732064, essv11732043, essv11731930, essv11731875, essv11732007, essv11732152, essv11731941, essv11731892, essv11732233, essv11731943, essv11731865, essv11732188, essv11732089, essv11732224, essv11732100, essv11731951, essv11732079, essv11732061, essv11732191, essv11732088, essv11732060, essv11732012, essv11732144, essv11732121, essv11732183, essv11732081, essv11732036, essv11732083, essv11731934, essv11732211, essv11732052, essv11731925, essv11732239, essv11732029, essv11732123, essv11732004, essv11732092, essv11732023, essv11731893, essv11732045, essv11731864, essv11732056, essv11732112, essv11732042, essv11732016, essv11731976, essv11731933, essv11731910, essv11731932, essv11732127, essv11732132, essv11731984, essv11732234, essv11731988, essv11732178, essv11732077, essv11732062, essv11732011, essv11732169, essv11732091, essv11732199, essv11731936

Samples

NA18745, HG04210, HG00442, HG04096, HG00143, NA21111, HG02072, HG00102, HG01624, HG01031, NA18565, NA21099, HG02784, NA20878, HG03717, NA18979, HG02727, NA20752, NA18528, HG02017, NA21137, NA18530, HG00737, HG01947, NA20863, NA18633, HG00097, HG03679, HG02769, NA19067, HG00693, NA20894, HG01873, HG03645, NA21135, NA18940, HG03770, HG00589, HG04038, NA20798, NA20589, HG01351, NA19678, NA21130, HG01168, HG01766, NA18567, NA18993, HG00129, HG03913, HG03736, NA18618, NA18571, HG03978, HG00451, HG00185, HG00537, HG00243, NA19079, NA18949, HG03817, HG03910, HG02252, HG02736, HG02187, HG00534, NA18748, HG01284, NA18966, HG02190, HG04047, NA18990, HG01844, HG01048, HG01121, HG02409, HG00365, HG04075, HG01164, NA18645, NA12777, NA12760, HG01847, HG01171, HG00282, NA19056, HG02793, HG01200, HG03718, HG00557, HG02057, HG00657, HG03928, HG02731, HG03491, HG01142, HG03900, HG02728, HG01077, NA20832, HG01323, NA18534, HG03781, NA19064, NA18548, NA20525, NA20867, NA20901, NA18626, NA20581, HG01870, HG03802, HG04173, HG01613, NA18532, HG01101, HG03953, HG03971, HG02783, NA19761, NA19009, NA18963, HG00704, HG01680, HG02332, HG00099, NA12778, HG03694, HG01075, NA18974, HG02660, HG00407, HG01812, NA20872, NA20851, HG04025, HG04216, HG02557, HG00254, HG00336, HG04026, NA19072, HG03695, HG03692, HG00734, HG01174, NA20790, HG03702, HG02232, HG04099, NA21095, HG01137, HG03727, HG02019, NA18610, HG03973, HG03703, HG04080, HG03729, NA20897, HG00614, NA06994, HG02700, HG02128, HG00513, HG02095, NA18631, HG02401, HG03977, NA20849, HG03849, NA21102, HG03733, NA20852, NA18636, HG01799, NA21093, HG03716, HG01631, HG00112, HG01468, HG02774, HG00105, NA18957, HG00628, NA12890, NA12006, NA19063, NA12154, HG04061, HG01509, HG03955, HG01805, NA20908, HG00553, HG00593, HG00626, HG00403, HG00096, NA18998, HG01413, NA21110, HG03857, HG00592, HG02652, HG03652, NA18592, NA12814, HG01773, HG01348, HG00524, HG00351, HG04229, HG02035, NA18561, HG03738, HG01280, NA18599, HG01389, NA18603, NA12045, HG00640, HG03668, HG01531, HG00452, HG02394, HG03792, HG00150, NA20507, NA12155, HG00327, HG02312, HG01503, NA20850, HG00689, NA20586, HG03976, HG02155, HG03873, NA20905, NA19916, NA18942, HG01816, HG02786, HG00590, NA20910, NA18611, HG03868, NA18749, HG03803, HG04214, HG03897, HG02395, NA20896, NA18977, HG01757, HG01072, HG03788, HG01308, HG00422, HG01405, HG01176, HG04238, NA19002, HG04185, HG03744, NA19725, HG00159, NA20764, NA18975, HG03884, NA18638, HG00260, NA21106, NA18614, HG03709, HG01353, HG01139, HG03902, HG00629, NA19082, HG02233, HG01595, HG01247, NA12342, HG04062, HG03644, HG02090, NA18956, NA20536, NA18991, HG03636, HG02554, NA20895, HG00584, NA18637, NA19658, HG01880, NA20767, HG04180, HG01852, HG00619, HG00708, HG01777, HG01161, HG03871, NA19000, HG00956, HG00844, NA20859, HG02604, NA19001, HG01791, HG00117, HG04189, HG00525, HG03745, HG02081, HG02031, NA20828, NA18536, HG03991, HG00410, HG01589, NA18546, NA21143, NA20522, HG02684, NA20801, NA18535, HG03809, HG00285, HG02223, HG04239, HG03899, HG00638, HG02651, HG00623, NA20785, NA18629, NA18643, HG03846, NA20516, HG02139, NA20803, NA20797, NA12874, NA21126, HG03019, NA20887, NA21125, NA20357, NA19078, HG01770, NA18971, HG04015, HG00409, HG03896, HG03646, HG01556, NA12749, HG00656, HG02396, HG03022, HG00123, NA21101, HG03998, HG03684, HG03615, HG02239, NA20807, HG00234, HG02186, NA18552, NA20886, HG00472, HG01464, HG03611, NA19755, HG03856, HG01672, HG03931, HG01191, NA18622, NA18965, HG03886, HG01747

Known Genes

TENM3

Method

Sequencing

Analysis

Platform

Multiple platforms

Comments

Reference

1000_Genomes_Consortium_Phase_3

Pubmed ID

21293372

Accession Number(s)

esv3603426

Frequency

Sample Size	2504
Observed Gain	0
Observed Loss	387
Observed Complex	0
Frequency	n/a