Variant Details

Variant: esv3598142

Internal ID

6985278

Landmark

Location Information

Type	Coordinates	Assembly	Other Links
	chr3:149245546..149251923	hg38	UCSC Ensembl
Inner	chr3:149245546..149251923	hg38	UCSC Ensembl
Outer	chr3:149245180..149252317	hg38	UCSC Ensembl
	chr3:148963333..148969710	hg19	UCSC Ensembl
Inner	chr3:148963333..148969710	hg19	UCSC Ensembl
Outer	chr3:148962967..148970104	hg19	UCSC Ensembl

Cytoband

3q25.1

Allele length

Assembly	Allele length
hg38	6378
hg19	6378

Variant Type

CNV loss

Copy Number

Allele State

Allele Origin

Probe Count

Validation Flag

Merged Status

Merged Variants

Supporting Variants

essv11180165, essv11180118, essv11180137, essv11180139, essv11180094, essv11180163, essv11180166, essv11180062, essv11180085, essv11180162, essv11180089, essv11180143, essv11180110, essv11180170, essv11180161, essv11180071, essv11180080, essv11180061, essv11180072, essv11180065, essv11180093, essv11180052, essv11180078, essv11180186, essv11180109, essv11180100, essv11180182, essv11180111, essv11180194, essv11180144, essv11180058, essv11180189, essv11180074, essv11180142, essv11180067, essv11180084, essv11180178, essv11180081, essv11180201, essv11180140, essv11180181, essv11180069, essv11180122, essv11180107, essv11180106, essv11180112, essv11180056, essv11180082, essv11180184, essv11180198, essv11180050, essv11180063, essv11180129, essv11180131, essv11180051, essv11180076, essv11180053, essv11180146, essv11180169, essv11180147, essv11180151, essv11180046, essv11180160, essv11180157, essv11180068, essv11180150, essv11180195, essv11180102, essv11180097, essv11180073, essv11180149, essv11180172, essv11180180, essv11180155, essv11180185, essv11180126, essv11180083, essv11180120, essv11180086, essv11180145, essv11180092, essv11180099, essv11180127, essv11180192, essv11180193, essv11180190, essv11180060, essv11180132, essv11180048, essv11180191, essv11180054, essv11180158, essv11180173, essv11180090, essv11180154, essv11180197, essv11180047, essv11180152, essv11180168, essv11180135, essv11180177, essv11180117, essv11180087, essv11180188, essv11180115, essv11180096, essv11180167, essv11180108, essv11180105, essv11180049, essv11180175, essv11180098, essv11180091, essv11180199, essv11180121, essv11180066, essv11180133, essv11180141, essv11180179, essv11180159, essv11180174, essv11180104, essv11180088, essv11180138, essv11180113, essv11180153, essv11180196, essv11180059, essv11180183, essv11180164, essv11180187, essv11180103, essv11180176, essv11180124, essv11180101, essv11180134, essv11180055, essv11180128, essv11180064, essv11180119, essv11180079, essv11180077, essv11180136, essv11180156, essv11180070, essv11180200, essv11180123, essv11180171, essv11180130, essv11180095, essv11180075, essv11180114, essv11180125, essv11180116, essv11180057, essv11180148

Samples

HG01437, NA18562, NA18620, NA18997, HG02386, NA20588, HG00881, HG01173, NA19058, HG00592, HG01521, HG03652, HG00231, HG01462, HG02385, HG01438, HG02026, NA19378, HG01326, HG03300, HG02231, HG00257, HG03607, HG02419, NA18999, HG00103, HG00654, NA18526, HG03679, HG01809, NA18602, HG00327, HG00717, NA18563, HG01250, HG00127, NA19076, HG01350, HG01070, HG02185, HG02491, HG02383, HG03370, HG03663, HG00851, NA20540, NA19088, NA12762, HG01848, HG00334, NA20513, NA19681, HG00451, NA19079, NA20910, NA18970, HG00335, HG03986, NA19719, NA18560, NA18966, HG00309, HG00182, NA19002, HG00406, NA20764, NA18985, HG01771, NA20342, HG01605, HG00530, HG00253, NA21122, HG00543, HG02402, NA18613, NA12760, HG01867, HG00268, HG02152, HG02090, NA21119, NA18956, HG02397, HG04195, NA19043, HG01612, HG01810, HG01845, HG01345, NA21098, HG01675, NA18630, HG04177, HG00551, NA12234, NA19064, HG01102, HG00284, HG03829, HG01073, NA20866, HG01762, HG00404, HG00531, NA11893, NA19009, NA06985, HG02031, HG00126, HG02408, HG01589, NA18945, HG03940, NA19012, HG01530, NA19436, NA20821, HG01858, HG00258, HG00476, NA18542, HG02684, HG02807, HG02557, NA19321, HG03708, HG01357, HG03702, HG00308, NA18992, HG00631, HG03469, HG01798, NA18943, HG00662, HG02188, HG01801, NA19117, HG01606, HG00672, HG02379, HG01491, HG02401, HG03733, HG03049, NA19468, HG03716, NA20786, HG01600, HG00131, NA19780, HG01377, HG02353, NA19011, HG01112

Known Genes

Method

Sequencing

Analysis

Platform

Multiple platforms

Comments

Reference

1000_Genomes_Consortium_Phase_3

Pubmed ID

21293372

Accession Number(s)

esv3598142

Frequency

Sample Size	2504
Observed Gain	0
Observed Loss	156
Observed Complex	0
Frequency	n/a