A curated catalogue of human genomic structural variation




Variant Details

Variant: esv3597566



Internal ID6984705
Landmark
Location Information
TypeCoordinatesAssemblyOther Links
chr3:119700988..119701701hg38UCSC Ensembl
Innerchr3:119701001..119701688hg38UCSC Ensembl
Outerchr3:119700975..119701714hg38UCSC Ensembl
chr3:119419835..119420548hg19UCSC Ensembl
Innerchr3:119419848..119420535hg19UCSC Ensembl
Outerchr3:119419822..119420561hg19UCSC Ensembl
Cytoband3q13.33
Allele length
AssemblyAllele length
hg38714
hg19714
Variant TypeCNV loss
Copy Number
Allele State
Allele Origin
Probe Count
Validation Flag
Merged StatusM
Merged Variants
Supporting Variantsessv11116793, essv11117124, essv11116919, essv11116980, essv11116523, essv11116424, essv11116978, essv11117024, essv11116386, essv11117146, essv11116833, essv11116550, essv11116470, essv11116412, essv11116649, essv11116385, essv11116788, essv11116736, essv11116582, essv11116709, essv11116536, essv11116897, essv11116786, essv11116767, essv11116972, essv11116660, essv11116421, essv11116995, essv11116502, essv11117126, essv11117007, essv11116516, essv11116408, essv11116899, essv11116929, essv11116998, essv11116680, essv11116903, essv11116982, essv11117059, essv11116512, essv11116436, essv11116861, essv11116481, essv11117096, essv11116587, essv11116593, essv11116486, essv11116456, essv11116683, essv11117117, essv11116968, essv11117050, essv11116837, essv11117019, essv11116413, essv11116876, essv11117056, essv11116777, essv11117070, essv11116927, essv11116545, essv11116965, essv11116779, essv11116810, essv11116778, essv11116766, essv11116637, essv11116446, essv11116640, essv11116682, essv11116626, essv11116462, essv11116956, essv11116560, essv11117088, essv11116996, essv11116774, essv11116507, essv11116509, essv11116684, essv11116802, essv11116966, essv11116790, essv11116738, essv11116816, essv11116540, essv11116458, essv11116849, essv11117046, essv11117061, essv11117025, essv11117022, essv11116932, essv11116589, essv11116853, essv11116669, essv11116785, essv11116741, essv11116829, essv11116390, essv11116731, essv11116559, essv11116674, essv11116472, essv11117081, essv11116848, essv11116494, essv11116854, essv11117023, essv11116969, essv11117140, essv11116514, essv11116394, essv11116520, essv11116723, essv11116706, essv11116453, essv11117075, essv11116445, essv11117043, essv11117055, essv11117028, essv11116823, essv11116663, essv11116629, essv11116398, essv11116753, essv11116679, essv11116604, essv11116627, essv11116592, essv11117089, essv11116763, essv11116605, essv11116557, essv11116600, essv11116653, essv11116733, essv11116433, essv11117147, essv11117119, essv11116739, essv11116675, essv11116666, essv11117006, essv11116508, essv11116586, essv11117041, essv11116620, essv11116755, essv11116967, essv11116533, essv11117027, essv11116948, essv11117086, essv11117030, essv11116970, essv11116655, essv11116452, essv11116885, essv11116672, essv11116621, essv11116817, essv11116877, essv11117066, essv11117136, essv11116712, essv11116945, essv11116805, essv11116572, essv11116563, essv11116405, essv11116999, essv11116971, essv11116704, essv11116410, essv11117123, essv11116687, essv11116450, essv11117004, essv11116886, essv11116991, essv11116631, essv11116579, essv11116872, essv11116807, essv11116787, essv11116939, essv11116491, essv11116943, essv11116393, essv11116889, essv11117076, essv11116780, essv11116619, essv11116841, essv11116784, essv11116776, essv11116657, essv11116958, essv11116734, essv11116465, essv11116838, essv11116803, essv11116701, essv11116716, essv11116411, essv11116554, essv11116916, essv11117122, essv11116819, essv11117072, essv11117012, essv11116635, essv11116549, essv11117017, essv11117037, essv11116477, essv11116454, essv11116874, essv11116726, essv11117084, essv11116771, essv11117138, essv11116475, essv11116856, essv11116530, essv11116414, essv11117032, essv11116764, essv11116503, essv11116595, essv11116891, essv11116505, essv11116457, essv11116740, essv11116883, essv11116467, essv11116639, essv11116431, essv11116474, essv11116455, essv11116992, essv11116950, essv11116843, essv11116607, essv11116430, essv11116527, essv11117099, essv11116395, essv11116577, essv11117074, essv11116937, essv11116870, essv11116518, essv11116429, essv11116910, essv11116750, essv11116583, essv11116574, essv11117029, essv11117026, essv11116698, essv11116469, essv11117144, essv11116578, essv11116722, essv11116831, essv11116466, essv11116973, essv11116500, essv11116435, essv11116997, essv11116857, essv11117125, essv11116830, essv11116524, essv11117109, essv11116418, essv11116871, essv11116699, essv11116918, essv11116707, essv11116901, essv11116800, essv11116717, essv11116725, essv11116420, essv11116630, essv11117128, essv11116820, essv11116537, essv11116444, essv11116893, essv11116783, essv11116988, essv11116977, essv11116542, essv11116609, essv11116868, essv11116845, essv11116963, essv11116795, essv11116961, essv11116772, essv11116673, essv11116792, essv11116532, essv11116668, essv11116703, essv11116681, essv11116688, essv11116737, essv11117133, essv11116747, essv11116835, essv11116416, essv11116608, essv11116875, essv11116955, essv11116851, essv11116628, essv11116904, essv11117115, essv11117131, essv11117095, essv11116756, essv11116567, essv11116720, essv11116434, essv11117102, essv11116449, essv11116842, essv11116661, essv11116616, essv11116451, essv11116459, essv11116606, essv11116392, essv11116426, essv11116762, essv11116888, essv11116695, essv11117092, essv11117039, essv11116947, essv11117127, essv11116658, essv11116689, essv11116564, essv11116922, essv11116743, essv11116388, essv11116492, essv11116850, essv11116422, essv11116789, essv11116746, essv11116396, essv11116917, essv11116808, essv11116614, essv11116403, essv11116566, essv11117002, essv11116825, essv11116584, essv11116678, essv11116815, essv11116404, essv11117098, essv11116569, essv11117101, essv11116976, essv11116915, essv11116879, essv11117111, essv11116538, essv11116957, essv11116758, essv11117015, essv11116596, essv11116585, essv11116892, essv11116834, essv11116571, essv11116499, essv11117082, essv11117034, essv11116401, essv11117001, essv11116895, essv11116782, essv11117060, essv11116511, essv11116498, essv11116748, essv11116504, essv11117011, essv11116601, essv11116580, essv11117130, essv11117078, essv11116911, essv11116423, essv11116417, essv11117118, essv11116828, essv11116912, essv11116822, essv11116654, essv11116575, essv11116700, essv11116718, essv11116791, essv11116442, essv11117116, essv11117009, essv11117062, essv11116535, essv11116415, essv11116989, essv11116659, essv11116463, essv11116942, essv11116708, essv11116515, essv11116711, essv11116979, essv11116983, essv11116624, essv11116730, essv11116844, essv11116884, essv11116724, essv11116981, essv11116632, essv11116484, essv11116670, essv11116715, essv11117067, essv11116744, essv11116544, essv11116811, essv11116555, essv11117047, essv11116930, essv11116873, essv11116925, essv11116647, essv11116852, essv11116521, essv11116900, essv11116591, essv11116389, essv11116397, essv11117016, essv11116933, essv11117069, essv11116962, essv11116960, essv11116443, essv11116719, essv11116840, essv11116460, essv11116496, essv11116476, essv11116846, essv11116694, essv11116727, essv11116464, essv11116882, essv11116728, essv11116887, essv11116581, essv11116573, essv11117107, essv11117049, essv11116713, essv11116478, essv11117042, essv11116826, essv11117064, essv11116914, essv11116847, essv11116461, essv11117053, essv11116752, essv11116447, essv11116501, essv11116561, essv11116928, essv11116419, essv11116804, essv11116921, essv11116556, essv11116399, essv11117120, essv11116613, essv11117114, essv11116599, essv11117112, essv11117113, essv11116754, essv11116691, essv11117052, essv11116543, essv11117045, essv11116652, essv11116994, essv11116479, essv11116383, essv11117044, essv11117106, essv11116773, essv11116506, essv11117108, essv11116827, essv11116905, essv11116902, essv11116656, essv11116602, essv11116539, essv11117090, essv11117087, essv11116751, essv11116984, essv11117040, essv11117104, essv11116964, essv11116702, essv11116641, essv11116878, essv11116495, essv11117073, essv11116940, essv11117142, essv11117058, essv11116959, essv11116667, essv11117141, essv11117018, essv11116648, essv11116603, essv11116622, essv11117014, essv11116676, essv11116949, essv11116770, essv11117000, essv11116797, essv11116858, essv11116487, essv11116664, essv11116529, essv11116821, essv11117036, essv11116909, essv11116866, essv11116721, essv11117005, essv11116742, essv11116615, essv11116597, essv11116553, essv11116525, essv11116551, essv11116908, essv11116636, essv11116568, essv11116913, essv11116546, essv11116862, essv11116517, essv11117083, essv11116485, essv11117105, essv11117038, essv11116775, essv11117121, essv11116869, essv11116643, essv11116440, essv11116860, essv11116705, essv11116519, essv11116448, essv11116697, essv11117063, essv11116941, essv11116610, essv11116974, essv11117071, essv11117033, essv11117132, essv11117065, essv11116437, essv11116798, essv11116438, essv11116749, essv11116645, essv11116384, essv11116894, essv11116642, essv11116387, essv11116799, essv11116677, essv11116493, essv11116490, essv11117134, essv11116935, essv11116898, essv11116936, essv11117129, essv11117008, essv11116824, essv11116522, essv11116806, essv11117085, essv11116931, essv11116534, essv11116497, essv11116483, essv11116951, essv11116468, essv11116662, essv11117079, essv11116513, essv11116954, essv11116809, essv11117139, essv11117021, essv11116757, essv11116409, essv11117010, essv11116625, essv11116985, essv11116760, essv11117135, essv11116634, essv11116768, essv11117031, essv11117143, essv11116759, essv11116391, essv11116671, essv11116618, essv11116441, essv11116907, essv11116570, essv11116425, essv11117103, essv11116923, essv11116794, essv11116696, essv11116611, essv11117097, essv11117068, essv11116745, essv11116864, essv11116590, essv11116406, essv11116541, essv11116855, essv11116812, essv11116526, essv11116665, essv11116865, essv11116598, essv11116531, essv11116471, essv11116836, essv11117048, essv11117003, essv11116732, essv11116814, essv11117054, essv11116944, essv11116650, essv11116946, essv11116400, essv11117077, essv11117110, essv11116859, essv11117035, essv11116986, essv11116975, essv11116428, essv11116993, essv11116953, essv11116685, essv11116594, essv11117100, essv11116510, essv11116769, essv11116990, essv11117020, essv11116813, essv11116765, essv11116934, essv11116548, essv11116646, essv11116920, essv11116839, essv11116407, essv11116482, essv11116565, essv11116926, essv11116761, essv11116729, essv11116880, essv11117145, essv11116547, essv11116617, essv11116480, essv11116558, essv11116906, essv11117080, essv11116867, essv11117137, essv11116638, essv11116623, essv11116924, essv11116382, essv11116801, essv11116552, essv11116692, essv11116489, essv11116881, essv11116863, essv11117051, essv11116896, essv11116576, essv11116427, essv11116987, essv11116588, essv11116644, essv11117093, essv11117013, essv11116633, essv11116796, essv11116690, essv11116528, essv11116710, essv11116402, essv11116686, essv11116735, essv11116952, essv11116612, essv11116473, essv11116439, essv11116781, essv11116651, essv11116890, essv11117057, essv11116714, essv11116488, essv11116832, essv11117091, essv11116938, essv11116693, essv11117094, essv11116562, essv11116432, essv11116818
SamplesHG03593, HG00650, HG01918, NA20891, HG00608, NA18647, HG04060, NA19378, HG03517, HG01326, NA18979, HG00233, HG02691, HG02323, HG01486, HG02050, HG03295, NA20864, NA18530, HG02215, HG03193, NA20863, HG01461, HG02356, NA18633, NA20359, NA12813, HG03837, HG00717, HG00138, HG01506, HG01350, HG00356, HG00589, NA20798, NA18995, NA19678, HG01676, NA21130, HG04206, HG02595, NA20911, HG02521, NA18993, NA18558, HG03913, HG01492, NA18960, NA18618, HG02645, HG02299, HG04070, HG03978, NA20291, NA19079, HG00158, HG00281, NA20759, HG03817, HG03520, HG02561, HG00632, HG02389, NA19238, NA19024, NA19172, HG01973, HG02588, HG02178, HG01950, HG04047, NA19239, NA19025, NA18867, HG01967, NA20515, NA19921, HG02134, HG02479, HG01164, HG00137, HG03697, NA20892, NA12489, HG03685, HG01501, NA19070, HG02793, HG01200, HG03088, HG03786, HG00657, HG02449, HG02253, NA19717, HG02084, HG03491, HG00344, HG01498, HG03775, NA12718, HG02728, NA20519, HG02014, NA18948, HG03781, NA20876, NA18548, NA18907, HG01047, HG01102, HG01762, NA19084, NA21086, HG00690, NA12829, HG00331, HG04173, HG02121, NA19750, HG04017, HG04063, HG02256, HG02286, HG00463, HG00099, NA12778, HG04176, HG02219, HG01988, NA19625, HG01625, NA19729, HG00382, HG04025, HG03848, NA18533, HG04216, NA19256, NA21144, HG04026, NA18564, HG03539, HG02308, HG02088, NA18628, NA19454, HG03458, NA19010, NA18865, HG03702, HG03869, NA19428, HG02464, NA18943, HG02580, NA20281, HG00662, NA18615, HG03703, HG02771, HG02133, NA19328, HG03600, HG00614, HG02128, HG02373, HG03157, HG01912, HG01804, NA19223, HG03279, HG02116, HG04098, HG01631, HG01269, HG03401, NA19121, HG01920, NA19011, NA18624, HG02351, HG03867, NA19065, HG03815, HG01509, NA19429, NA19431, NA11832, NA20772, HG01507, NA20762, HG00096, NA18998, HG03812, HG02339, HG01441, NA19700, HG00592, HG00121, HG01054, NA18924, HG02272, HG03965, HG01961, HG01359, HG03821, HG02702, NA20899, HG01586, HG01188, NA18881, HG02150, HG02852, HG02275, HG01389, HG01374, HG00306, NA18603, HG01305, NA12004, NA18625, NA12058, HG00150, NA19669, HG02734, HG04001, HG02285, HG01924, NA19068, NA19746, HG01341, NA19076, HG01503, NA18550, NA12812, HG03086, HG03099, HG02151, HG02407, NA19728, NA20890, HG02541, NA19723, NA18635, NA20900, HG03765, HG02620, HG01945, HG00610, HG03246, HG01354, NA12287, HG03911, HG03629, HG04131, HG03594, HG00590, HG03830, HG03868, HG03851, HG00277, NA12005, HG00120, HG00683, HG03986, HG02003, NA18617, NA19471, HG01176, HG01892, NA12815, NA12828, HG03583, HG02882, NA18973, HG00419, HG03884, NA18638, HG00464, HG00108, HG01699, HG01603, NA20818, HG00543, HG03780, HG02570, NA18613, HG00629, NA19657, HG03160, HG00183, HG00176, NA19082, HG00982, NA12342, HG03644, NA19077, HG02582, HG02090, NA19462, NA12872, HG01790, HG02076, HG01938, HG04162, HG02554, HG02953, HG00500, HG02497, NA20770, NA19776, HG01948, HG02555, HG01619, NA19118, HG03824, NA19655, HG03202, HG02494, HG03397, NA19031, HG04155, NA20881, NA19001, HG03625, NA18853, HG03391, HG02725, NA06985, HG00141, NA18536, HG02399, HG01589, HG03940, NA21143, NA19401, NA18978, HG03866, NA18535, NA19108, NA18952, NA18543, HG03461, HG01954, HG02759, NA12775, HG02501, HG03838, HG02983, HG01362, HG00638, HG01598, HG00631, HG03127, HG01951, HG00607, NA18629, HG03012, NA20504, NA19786, NA18591, NA20803, NA21094, HG03681, NA21125, NA19818, NA19323, NA19078, HG01432, HG03025, HG02938, HG00288, NA19713, HG00174, HG03998, NA19726, NA18972, NA18552, HG02861, HG01464, HG03611, HG02343, HG01583, HG00437, NA19153, HG01747, NA18745, NA12383, NA20882, HG02658, NA12717, HG01412, HG01173, HG00304, HG00143, HG02481, HG01462, HG01624, NA19066, NA12273, HG00358, HG02375, HG01815, HG00766, HG02727, HG01066, NA20802, NA19350, HG02804, NA20298, HG03926, NA20332, NA18959, HG00115, NA20517, HG01051, HG00097, NA20771, NA18510, HG03009, HG00641, NA21135, NA18940, HG00272, HG02016, NA18597, HG03943, HG03452, HG01702, NA19764, HG02105, HG01351, HG02383, HG01168, NA18923, HG02266, HG02085, NA19062, HG03342, HG01761, NA20822, NA19457, NA18571, HG02733, HG00451, HG00185, NA19904, NA19130, HG02981, HG02278, HG01069, HG02252, HG01080, NA20518, NA21109, HG00534, NA18966, HG01525, HG04020, HG02190, NA20889, HG00118, NA18990, NA18557, HG02545, HG01121, HG02780, HG00253, NA21105, HG00365, NA18539, HG00743, HG01124, NA18645, HG00349, HG00154, HG02820, HG00443, HG03861, NA19670, NA18525, NA19006, NA19403, HG02345, NA21119, NA20885, HG02057, NA19455, HG00132, NA20314, HG00556, HG01142, HG01941, NA18579, HG01149, HG01607, HG00551, HG04235, HG03472, HG03730, NA20866, NA18626, HG00350, NA19042, HG02787, HG03802, NA20856, HG02259, HG01101, HG00140, HG03953, HG03971, HG03969, HG02979, NA12144, HG04159, NA18570, HG02594, NA18858, HG01956, HG01075, NA19012, HG03653, NA12043, HG03064, HG03238, HG00407, NA19375, NA18632, HG02089, HG00155, NA19309, HG04006, NA19147, HG01980, HG01131, HG02220, HG04186, HG01685, NA19090, HG01272, HG01357, NA21123, NA20530, NA20527, NA20362, HG01375, NA20778, HG01113, NA20544, HG01137, HG03727, NA19783, NA18610, HG03779, NA18501, HG03642, NA20847, HG03977, HG03066, NA20849, NA21102, HG04014, HG02107, HG01302, NA20852, NA21133, NA20510, NA19185, NA20786, HG03925, HG03872, NA19780, HG03077, HG00728, NA18983, NA20502, HG01431, HG02020, HG01125, HG00171, NA12006, NA18623, HG04061, NA18740, HG01927, HG03439, NA19676, HG01516, NA18997, HG03741, HG00403, HG03773, NA19222, HG03857, HG03548, HG02298, HG00351, HG03237, HG01860, NA19332, NA20274, NA20531, NA21092, HG01970, HG00318, NA19795, HG03668, HG01531, NA20805, HG01944, HG01971, HG03895, HG03518, HG02271, HG00177, HG01632, HG02023, NA07357, HG03680, HG00327, HG03074, NA19374, HG00127, NA19005, NA18944, HG01682, HG03135, NA19762, NA19448, NA20586, NA19198, NA11992, HG00851, NA19088, NA21103, HG01510, HG02489, NA18611, HG01455, NA18970, HG03897, HG01398, HG01067, HG03968, HG01495, NA19731, HG03696, HG01405, NA21107, HG01440, HG01932, HG04185, HG02073, HG00159, NA18864, HG03058, NA21114, HG03114, NA18954, NA18648, HG01312, HG03862, HG00133, HG02737, HG01183, HG01139, HG00290, NA20854, HG03785, HG02265, NA19210, HG03908, NA19437, HG01187, NA18934, HG01595, HG02513, HG01247, HG00328, HG01162, HG00701, HG01515, NA19913, HG02108, HG00533, HG02390, HG02470, HG01808, NA18630, HG00619, HG01049, HG00708, HG02364, NA18566, HG01073, NA19114, NA20299, HG03136, NA19113, HG00613, NA19740, NA19320, HG02292, HG04152, NA19257, HG00276, HG01890, HG01286, HG03774, NA18634, NA20534, HG01204, NA18546, HG02813, NA21087, HG01444, NA18542, HG03778, HG02807, NA18909, HG03809, HG01190, NA19321, NA18961, HG02223, HG02682, HG00357, HG01915, NA19435, HG02923, NA19773, NA19144, HG01977, NA19439, HG02685, NA19741, NA12874, NA07037, NA19475, HG03084, NA18971, HG01556, HG03863, HG03049, HG02392, HG01055, HG00123, HG02239, HG03410, HG00234, HG00131, NA19096, HG01872, HG01105, HG02052, HG03882, NA18488, HG03856, NA19758, HG02425, NA21104, HG03931, HG03129, NA12776
Known Genes
MethodSequencing
Analysis
PlatformMultiple platforms
Comments
Reference1000_Genomes_Consortium_Phase_3
Pubmed ID21293372
Accession Number(s)esv3597566
Frequency
Sample Size2504
Observed Gain0
Observed Loss766
Observed Complex0
Frequencyn/a


Hosted by The Centre for Applied Genomics
Grant support for DGV
Please read the usage disclaimer