Variant DetailsVariant: esv2745546 | Internal ID | 9979830 | | Landmark | | | Location Information | | | Cytoband | 12p13.2 | | Allele length | | Assembly | Allele length | | hg38 | 98020 | | hg19 | 98020 |
| | Variant Type | CNV deletion | | Copy Number | | | Allele State | | | Allele Origin | | | Probe Count | | | Validation Flag | | | Merged Status | M | | Merged Variants | | | Supporting Variants | essv6716775, essv6908845, essv6831292, essv6687142, essv6908849, essv6706196, essv6931820, essv6691588, essv6719931, essv6940312, essv6772033, essv6771775, essv6944913, essv6712971, essv6702426, essv6882299, essv6831293, essv6865410, essv6857161, essv6796006, essv6768494, essv6724483, essv6755523, essv6744010, essv6783549, essv6779447, essv6944919, essv6695526, essv6809350, essv6720153, essv6940320, essv6873657, essv6698729, essv6870704, essv6908507, essv6838593, essv6938840, essv6897626, essv6944922, essv6741053, essv6720663, essv6851137, essv6873663, essv6763377, essv6765756, essv6965746, essv6916105, essv6959231, essv6732103, essv6687154, essv6706204, essv6971006, essv6746826, essv6931823, essv6768488, essv6842424, essv6803489, essv6735162, essv6677797, essv6737877, essv6867123, essv6803483, essv6768491, essv6924313, essv6779441, essv6738187, essv6712970, essv6712975, essv6735167, essv6800197, essv6834870, essv6940317, essv6938806, essv6688264, essv6834821, essv6772032, essv6809355, essv6908838, essv6842419, essv6709476, essv6971162, essv6940322, essv6842418, essv6805454, essv6688273, essv6735160, essv6879471, essv6867122, essv6787737, essv6838595, essv6867125, essv6908540, essv6885069, essv6904901, essv6763381, essv6709474, essv6815447, essv6668204, essv6800201, essv6768483, essv6870706, essv6977135, essv6944917, essv6809354, essv6735164, essv6746825, essv6732105, essv6865454, essv6738131, essv6709471, essv6809357, essv6755528, essv6834776, essv6806363, essv6805443, essv6738154, essv6673118, essv6887987, essv6971062, essv6812198, essv6897629, essv6738142, essv6706201, essv6695525, essv6912580, essv6970779, essv6815449, essv6897628, essv6702425, essv6865465, essv6771764, essv6971028, essv6760959, essv6862348, essv6831291, essv6885070, essv6959233, essv6927913, essv6677794, essv6900635, essv6800196, essv6867127, essv6720486, essv6783551, essv6806367, essv6687231, essv6857158, essv6908844, essv6791838, essv6677793, essv6977136, essv6927911, essv6712972, essv6681557, essv6882303, essv6685067, essv6691586, essv6842423, essv6673122, essv6899099, essv6698731, essv6894630, essv6744014, essv6912572, essv6791839, essv6827683, essv6936105, essv6812201, essv6834869, essv6698736, essv6741051, essv6870710, essv6867129, essv6695524, essv6938873, essv6927915, essv6977140, essv6959230, essv6842417, essv6752556, essv6724477, essv6949071, essv6938895, essv6709470, essv6940316, essv6870711, essv6912573, essv6681552, essv6845936, essv6685064, essv6702428, essv6744011, essv6787741, essv6771753, essv6908836, essv6904898, essv6805432, essv6953202, essv6787739, essv6691582, essv6944915, essv6916114, essv6838594, essv6791835, essv6924322, essv6815451, essv6806366, essv6936103, essv6812200, essv6709472, essv6857168, essv6971017, essv6710955, essv6724478, essv6931815, essv6920161, essv6720375, essv6965744, essv6741055, essv6815448, essv6709477, essv6775679, essv6732106, essv6688263, essv6870707, essv6891267, essv6920160, essv6908485, essv6891263, essv6775684, essv6936104, essv6758213, essv6673117, essv6749668, essv6741052, essv6862346, essv6916110, essv6775683, essv6876645, essv6724479, essv6803486, essv6899088, essv6897635, essv6879477, essv6796011, essv6851136, essv6819663, essv6831290, essv6851139, essv6702430, essv6720042, essv6845937, essv6819665, essv6752552, essv6924316, essv6698730, essv6949070, essv6940321, essv6940313, essv6806365, essv6698732, essv6771742, essv6735166, essv6732108, essv6687176, essv6879472, essv6823608, essv6879470, essv6805510, essv6970995, essv6944921, essv6673123, essv6716780, essv6857159, essv6916103, essv6803485, essv6876642, essv6904897, essv6737874, essv6737872, essv6862345, essv6755524, essv6944926, essv6891268, essv6809351, essv6823607, essv6673119, essv6965745, essv6870717, essv6763380, essv6668203, essv6775680, essv6870703, essv6783555, essv6862343, essv6779442, essv6904899, essv6900633, essv6772029, essv6768485, essv6904900, essv6959232, essv6879476, essv6867128, essv6765755, essv6763378, essv6949068, essv6851135, essv6912576, essv6702427, essv6809352, essv6681551, essv6927908, essv6765757, essv6879473, essv6791833, essv6728315, essv6899143, essv6920155, essv6938829, essv6716773, essv6887989, essv6865421, essv6904894, essv6716779, essv6953208, essv6768492, essv6685061, essv6920149, essv6953212, essv6862349, essv6755527, essv6931822, essv6720932, essv6685063, essv6916104, essv6851141, essv6862344, essv6899077, essv6732107, essv6920154, essv6803484, essv6760958, essv6772028, essv6862350, essv6938862, essv6920156, essv6908496, essv6873665, essv6677795, essv6710933, essv6763382, essv6944916, essv6791834, essv6673120, essv6894629, essv6698735, essv6716772, essv6931816, essv6752551, essv6737875, essv6800194, essv6775682, essv6796005, essv6815450, essv6908837, essv6851138, essv6812205, essv6908529, essv6971128, essv6787742, essv6720667, essv6953205, essv6940315, essv6949076, essv6953209, essv6685062, essv6768490, essv6687131, essv6758214, essv6787738, essv6908843, essv6758212, essv6728317, essv6971106, essv6738120, essv6796010, essv6970777, essv6796007, essv6949075, essv6857164, essv6831289, essv6688262, essv6706203, essv6924321, essv6805499, essv6673116, essv6870705, essv6812204, essv6916106, essv6867124, essv6873659, essv6688271, essv6716781, essv6867126, essv6977134, essv6691580, essv6882304, essv6712973, essv6936102, essv6851143, essv6827682, essv6719709, essv6876646, essv6752558, essv6873658, essv6924317, essv6823603, essv6865388, essv6706199, essv6876644, essv6720669, essv6899110, essv6706197, essv6970778, essv6936101, essv6912577, essv6838596, essv6924315, essv6685066, essv6809358, essv6775685, essv6738176, essv6904902, essv6971051, essv6685068, essv6805465, essv6800198, essv6710910, essv6873666, essv6710899, essv6677796, essv6720668, essv6970781, essv6775681, essv6873656, essv6741056, essv6681556, essv6865476, essv6687187, essv6706195, essv6940314, essv6897627, essv6867130, essv6716774, essv6698734, essv6924314, essv6865399, essv6904895, essv6819667, essv6806362, essv6706205, essv6746831, essv6823604, essv6953207, essv6912571, essv6894628, essv6758216, essv6791831, essv6857160, essv6768489, essv6949069, essv6691584, essv6885072, essv6965747, essv6879474, essv6710921, essv6908839, essv6944914, essv6720662, essv6899121, essv6687209, essv6873655, essv6732104, essv6806361, essv6834787, essv6970780, essv6944920, essv6870715, essv6772030, essv6920157, essv6716777, essv6681550, essv6823609, essv6732109, essv6805488, essv6720665, essv6687165, essv6949073, essv6891264, essv6809356, essv6768493, essv6749667, essv6706200, essv6876641, essv6823605, essv6971040, essv6763379, essv6800195, essv6900634, essv6779444, essv6959228, essv6920153, essv6720264, essv6931819, essv6728319, essv6673115, essv6965749, essv6845935, essv6885071, essv6900629, essv6938851, essv6938818, essv6908841, essv6899132, essv6677792, essv6755525, essv6862351, essv6838592, essv6924320, essv6927910, essv6791837, essv6749666, essv6882300, essv6758211, essv6735163, essv6735168, essv6927909, essv6900630, essv6737873, essv6691581, essv6728316, essv6800202, essv6977138, essv6783550, essv6870713, essv6702429, essv6885073, essv6763384, essv6681549, essv6931821, essv6912575, essv6800200, essv6879479, essv6812197, essv6953204, essv6882301 | | Samples | SSM100, SSM059, SSM036, SSM008, SSM083, SSM071, SSM027, SSM024, SSM075, SSM045, SSM046, SSM011, SSM064, SSM079, SSM065, SSM087, SSM038, SSM097, SSM039, SSM013, SSM009, SSM073, SSM093, SSM050, SSM074, SSM042, SSM088, SSM002, SSM041, SSM057, SSM023, SSM058, SSM028, SSM092, SSM084, SSM090, SSM021, SSM047, SSM018, SSM069, SSM061, SSM029, SSM096, SSM062, SSM026, SSM089, SSM017, SSM019, SSM035, SSM094, SSM032, SSM003, SSM031, SSM067, SSM044, SSM001, SSM014, SSM086, SSM033, SSM066, SSM006, SSM085, SSM068, SSM081, SSM040, SSM072, SSM082, SSM020, SSM007, SSM015, SSM078, SSM016, SSM053, SSM005, SSM080, SSM037, SSM077, SSM076, SSM022, SSM010, SSM091, SSM055, SSM070, SSM095, SSM025, SSM034, SSM004, SSM099, SSM043, SSM052, SSM098, SSM049, SSM056, SSM030, SSM063, SSM012 | | Known Genes | PRH1-PRR4, TAS2R19, TAS2R20, TAS2R31, TAS2R46, TAS2R50 | | Method | Sequencing | | Analysis | Breakdancer:4 times standard deviation,VariationHunter:4 times standard deviation and at least 3 supportting reads | | Platform | Illumina HiSeq 2000 | | Comments | | | Reference | Wong_et_al_2012b | | Pubmed ID | 23290073 | | Accession Number(s) | esv2745546
| | Frequency | | Sample Size | 96 | | Observed Gain | 0 | | Observed Loss | 96 | | Observed Complex | 0 | | Frequency | n/a |
|
|
