A curated catalogue of human genomic structural variation




Variant Details

Variant: esv2731841



Internal ID10315477
Landmark
Location Information
TypeCoordinatesAssemblyOther Links
Outerchr6:32471912..32537062hg38UCSC Ensembl
Outerchr6:32439689..32504839hg19UCSC Ensembl
Cytoband6p21.32
Allele length
AssemblyAllele length
hg3865151
hg1965151
Variant TypeCNV deletion
Copy Number
Allele State
Allele Origin
Probe Count
Validation Flag
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Known GenesHLA-DRB5
MethodSequencing
AnalysisBreakdancer:4 times standard deviation,VariationHunter:4 times standard deviation and at least 3 supportting reads
PlatformIllumina HiSeq 2000
Comments
ReferenceWong_et_al_2012b
Pubmed ID23290073
Accession Number(s)esv2731841
Frequency
Sample Size96
Observed Gain0
Observed Loss90
Observed Complex0
Frequencyn/a


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