Variant DetailsVariant: esv2731812 | Internal ID | 9966130 | | Landmark | | | Location Information | | | Cytoband | 6p21.33 | | Allele length | | Assembly | Allele length | | hg38 | 306659 | | hg19 | 306659 |
| | Variant Type | CNV deletion | | Copy Number | | | Allele State | | | Allele Origin | | | Probe Count | | | Validation Flag | | | Merged Status | M | | Merged Variants | dgv995e201 | | Supporting Variants | essv6869666, essv6676496, essv6676497, essv6890183, essv6786340, essv6762606, essv6757360, essv6869668, essv6878587, essv6794618, essv6926746, essv6790467, essv6727077, essv6938942, essv6886977, essv6849072, essv6802548, essv6770774, essv6860781, essv6825621, essv6782138, essv6667518, essv6751556, essv6728320, essv6926744, essv6890180, essv6690374, essv6903691, essv6830129, essv6697897, essv6728398, essv6687210, essv6915026, essv6849068, essv6883042, essv6805369, essv6778139, essv6728387, essv6974720, essv6736937, essv6833718, essv6704948, essv6759989, essv6938948, essv6798784, essv6786338, essv6926745, essv6881362, essv6683961, essv6860783, essv6754481, essv6974721, essv6767469, essv6782141, essv6951828, essv6865547, essv6790468, essv6878583, essv6849074, essv6841222, essv6794754, essv6923014, essv6918726, essv6687213, essv6855159, essv6903698, essv6960296, essv6844889, essv6778128, essv6743123, essv6778134, essv6762607, essv6833725, essv6882708, essv6943346, essv6844883, essv6947757, essv6872678, essv6683963, essv6881366, essv6887744, essv6903697, essv6778133, essv6770778, essv6728364, essv6911314, essv6947748, essv6899651, essv6743115, essv6878582, essv6893493, essv6730847, essv6727078, essv6703399, essv6855020, essv6825610, essv6774562, essv6671050, essv6887655, essv6884181, essv6860787, essv6855160, essv6757365, essv6930390, essv6683967, essv6844881, essv6687212, essv6734317, essv6728331, essv6760154, essv6719365, essv6728376, essv6855031, essv6701011, essv6754480, essv6896757, essv6770781, essv6759988, essv6918730, essv6811271, essv6887733, essv6822408, essv6704952, essv6708386, essv6960329, essv6826334, essv6694116, essv6774566, essv6676492, essv6927829, essv6677966, essv6794809, essv6934650, essv6869662, essv6887722, essv6727075, essv6960185, essv6837405, essv6782140, essv6833726, essv6814259, essv6703343, essv6926738, essv6837412, essv6974710, essv6770776, essv6680350, essv6814260, essv6794765, essv6723181, essv6956931, essv6841215, essv6882597, essv6805363, essv6757362, essv6930397, essv6837408, essv6947754, essv6671059, essv6778140, essv6886973, essv6715471, essv6930392, essv6739948, essv6826335, essv6960229, essv6855161, essv6956933, essv6896752, essv6855166, essv6841219, essv6727070, essv6786339, essv6778131, essv6754478, essv6723175, essv6680349, essv6719361, essv6805370, essv6694114, essv6896759, essv6782145, essv6860785, essv6794832, essv6743120, essv6794798, essv6751554, essv6748694, essv6927840, essv6903692, essv6844878, essv6825676, essv6711794, essv6757359, essv6743114, essv6872676, essv6762601, essv6743122, essv6927806, essv6730852, essv6860784, essv6694118, essv6745912, essv6745913, essv6875658, essv6865545, essv6951830, essv6719359, essv6818170, essv6808359, essv6683960, essv6762600, essv6915028, essv6694117, essv6934655, essv6911310, essv6903699, essv6844882, essv6872681, essv6736938, essv6814262, essv6875661, essv6814270, essv6701009, essv6915030, essv6934654, essv6825665, essv6798782, essv6872677, essv6728420, essv6883486, essv6794743, essv6751555, essv6680346, essv6915027, essv6759986, essv6745911, essv6969305, essv6748702, essv6903700, essv6703410, essv6907481, essv6884179, essv6826341, essv6855162, essv6969308, essv6872687, essv6844885, essv6711800, essv6680351, essv6881363, essv6770773, essv6794616, essv6934653, essv6865546, essv6960196, essv6938944, essv6728342, essv6719360, essv6951835, essv6960307, essv6960263, essv6826344, essv6960174, essv6678010, essv6798787, essv6715483, essv6734312, essv6963659, essv6734316, essv6734314, essv6786335, essv6703421, essv6723179, essv6704945, essv6739953, essv6951039, essv6878584, essv6960285, essv6865541, essv6825654, essv6743112, essv6918733, essv6915036, essv6886978, essv6833719, essv6767473, essv6915032, essv6770780, essv6767476, essv6704947, essv6963657, essv6802547, essv6907493, essv6778136, essv6860776, essv6743118, essv6814263, essv6760142, essv6818171, essv6727072, essv6708384, essv6869663, essv6757361, essv6748699, essv6915033, essv6671067, essv6778130, essv6734318, essv6875656, essv6814264, essv6683966, essv6837413, essv6802542, essv6855163, essv6680353, essv6950928, essv6943347, essv6703377, essv6841216, essv6794612, essv6882486, essv6677977, essv6798783, essv6730850, essv6764969, essv6938938, essv6918728, essv6884177, essv6822406, essv6969304, essv6739952, essv6875660, essv6760165, essv6849066, essv6676495, essv6825687, essv6938947, essv6923020, essv6841218, essv6759991, essv6687211, essv6969303, essv6767472, essv6947755, essv6974719, essv6794821, essv6778126, essv6903694, essv6837407, essv6794614, essv6782142, essv6860777, essv6728409, essv6960318, essv6930393, essv6671062, essv6825632, essv6736940, essv6826337, essv6903689, essv6860774, essv6730848, essv6881370, essv6930395, essv6881365, essv6715484, essv6844884, essv6814269, essv6671057, essv6883153, essv6759994, essv6950817, essv6887777, essv6886974, essv6938946, essv6855169, essv6762604, essv6907491, essv6762602, essv6875657, essv6808358, essv6760131, essv6907488, essv6677999, essv6911313, essv6826336, essv6869660, essv6680352, essv6760176, essv6715479, essv6671063, essv6930394, essv6825643, essv6736936, essv6704953, essv6882819, essv6818172, essv6883708, essv6687214, essv6915035, essv6751557, essv6703365, essv6680356, essv6872680, essv6869669, essv6960139, essv6822407, essv6794698, essv6826343, essv6760120, essv6818174, essv6887699, essv6811276, essv6715482, essv6727066, essv6715474, essv6680348, essv6837406, essv6802546, essv6896760, essv6825599, essv6727079, essv6708385, essv6770771, essv6822405, essv6805364, essv6974717, essv6915025, essv6808361, essv6711799, essv6739949, essv6865538, essv6830130, essv6956927, essv6767471, essv6911311, essv6882375, essv6875654, essv6956928, essv6778137, essv6671060, essv6671049, essv6704946, essv6794608, essv6782144, essv6855164, essv6896756, essv6896755, essv6865544, essv6808360, essv6770770, essv6865539, essv6860772, essv6704950, essv6947756, essv6918731, essv6719363, essv6951831, essv6896753, essv6770779, essv6723171, essv6754477, essv6855009, essv6748696, essv6805366, essv6715472, essv6887666, essv6872682, essv6794776, essv6794615, essv6923015, essv6943351, essv6923016, essv6764971, essv6734311, essv6743116, essv6927851, essv6911312, essv6798786, essv6974723, essv6727068, essv6907492, essv6878589, essv6963655, essv6727064, essv6704940, essv6833720, essv6923019, essv6899655, essv6802541, essv6676494, essv6757363, essv6849071, essv6736939, essv6918727, essv6790477, essv6872683, essv6794611, essv6811273, essv6947747, essv6739951, essv6896758, essv6830133, essv6708388, essv6849067, essv6814261, essv6881361, essv6884180, essv6690375, essv6875659, essv6694111, essv6918735, essv6764970, essv6893494, essv6703388, essv6805367, essv6671052, essv6950595, essv6704944, essv6887688, essv6790470, essv6899653, essv6739947, essv6811272, essv6751551, essv6739946, essv6903690, essv6974714, essv6878585, essv6748700, essv6767474, essv6786336, essv6918725, essv6782139, essv6872679, essv6814268, essv6711801, essv6849070, essv6915031, essv6918732, essv6762596, essv6694113, essv6728353, essv6798790, essv6869667, essv6723182, essv6956934, essv6907487, essv6926737, essv6844888, essv6671058, essv6884175, essv6923021, essv6844877, essv6811270, essv6701008, essv6960163, essv6794617, essv6947753, essv6943352, essv6960152, essv6727067, essv6694112, essv6715477, essv6794687, essv6875662, essv6748693, essv6907483, essv6790475, essv6837410, essv6841221, essv6764972, essv6974711, essv6748692, essv6960240, essv6869670, essv6844879, essv6822404, essv6703332, essv6759990, essv6711796, essv6911309, essv6887766, essv6947750, essv6774565, essv6762605, essv6950484, essv6869661, essv6711797, essv6881368, essv6727069, essv6903693, essv6719362, essv6872684, essv6667516, essv6926743, essv6943353, essv6723180, essv6950706, essv6727071, essv6881359, essv6748695, essv6711793, essv6878588, essv6884178, essv6844873, essv6727074, essv6841214, essv6860780, essv6671051, essv6811275, essv6841217, essv6794620, essv6704941, essv6683964, essv6794732, essv6762603, essv6704949, essv6818173, essv6918734, essv6943349, essv6855167, essv6907486, essv6882930, essv6683968, essv6886972, essv6751552, essv6697899, essv6934656, essv6782137, essv6743111, essv6893495, essv6960218, essv6748697, essv6881369, essv6701012, essv6759992, essv6960251, essv6743113, essv6826338, essv6794619, essv6767470, essv6671061, essv6963656, essv6708383, essv6951834, essv6786343, essv6739945, essv6697900, essv6671054, essv6730853, essv6927818, essv6860773, essv6727080, essv6701007, essv6849073, essv6786341, essv6770777, essv6974715, essv6881367, essv6759993, essv6934657, essv6887711, essv6855043, essv6943342, essv6938941, essv6704951, essv6969306, essv6865542, essv6723178, essv6833723, essv6951150, essv6754479, essv6683962, essv6951833, essv6890181, essv6811274, essv6956932, essv6734313, essv6837415, essv6943345, essv6899646, essv6790473, essv6926742, essv6805362, essv6667517, essv6907490, essv6849069, essv6830132, essv6844874, essv6703354, essv6926747, essv6786337, essv6869665, essv6727073, essv6833724, essv6704942, essv6805368, essv6794710, essv6883597, essv6687208, essv6676498, essv6860779, essv6748703, essv6790469, essv6825587, essv6764968, essv6690378, essv6844886, essv6883264, essv6764967, essv6960274, essv6774561, essv6860778, essv6903695, essv6855168, essv6671056, essv6883819, essv6739944, essv6974713, essv6830134, essv6887755, essv6743119, essv6947752, essv6844880, essv6734315, essv6974722, essv6837411, essv6923017, essv6855054, essv6762599, essv6951832, essv6826339, essv6951262, essv6947749, essv6841213, essv6974716, essv6778129, essv6837404, essv6865549, essv6790474, essv6938945, essv6694115, essv6719358, essv6715475, essv6680355, essv6890182, essv6715481, essv6837414, essv6963658, essv6875663, essv6886976, essv6798785, essv6926741, essv6887677, essv6960207, essv6790478, essv6818169, essv6711802, essv6762608, essv6677988, essv6943348, essv6808357, essv6778135, essv6730849, essv6802545, essv6899650, essv6774560, essv6951373, essv6715480, essv6798789, essv6814267, essv6743117, essv6730851, essv6860782, essv6794787, essv6938943, essv6875655, essv6739950, essv6881357, essv6883375, essv6715478, essv6907482, essv6748701, essv6719357, essv6711803, essv6715473, essv6915034, essv6802544, essv6923013, essv6907489, essv6774563, essv6671065, essv6754482, essv6826340, essv6676493, essv6974724, essv6974712, essv6778127, essv6930391, essv6869659, essv6794613, essv6899652, essv6680347, essv6770772, essv6690379, essv6899648, essv6899647, essv6711795, essv6778138, essv6833722, essv6881358, essv6918736, essv6723176, essv6711804, essv6881360, essv6872685, essv6899649, essv6865540, essv6671053, essv6811278, essv6671064, essv6865548, essv6822409 | | Samples | SSM100, SSM059, SSM036, SSM008, SSM083, SSM071, SSM027, SSM024, SSM075, SSM045, SSM046, SSM011, SSM064, SSM079, SSM065, SSM087, SSM038, SSM097, SSM039, SSM013, SSM009, SSM073, SSM093, SSM050, SSM074, SSM042, SSM088, SSM002, SSM041, SSM057, SSM023, SSM058, SSM028, SSM092, SSM084, SSM090, SSM021, SSM047, SSM018, SSM069, SSM061, SSM029, SSM096, SSM062, SSM026, SSM089, SSM017, SSM019, SSM035, SSM094, SSM032, SSM003, SSM031, SSM067, SSM044, SSM001, SSM014, SSM086, SSM033, SSM066, SSM006, SSM085, SSM068, SSM081, SSM040, SSM072, SSM082, SSM020, SSM007, SSM015, SSM078, SSM016, SSM053, SSM005, SSM080, SSM037, SSM077, SSM076, SSM022, SSM010, SSM091, SSM055, SSM070, SSM095, SSM025, SSM034, SSM004, SSM099, SSM043, SSM052, SSM098, SSM049, SSM056, SSM030, SSM063, SSM012 | | Known Genes | ATP6V1G2-DDX39B, DDX39B, HCG26, HCP5, HLA-B, HLA-C, MCCD1, MICA, MICB, MIR6891 | | Method | Sequencing | | Analysis | Breakdancer:4 times standard deviation,VariationHunter:4 times standard deviation and at least 3 supportting reads | | Platform | Illumina HiSeq 2000 | | Comments | | | Reference | Wong_et_al_2012b | | Pubmed ID | 23290073 | | Accession Number(s) | esv2731812
| | Frequency | | Sample Size | 96 | | Observed Gain | 0 | | Observed Loss | 96 | | Observed Complex | 0 | | Frequency | n/a |
|
|
