Variant DetailsVariant: esv2731767 Internal ID | 9966085 | Landmark | | Location Information | | Cytoband | 6p22.1 | Allele length | Assembly | Allele length | hg38 | 234084 | hg19 | 234084 |
| Variant Type | CNV deletion | Copy Number | | Allele State | | Allele Origin | | Probe Count | | Validation Flag | | Merged Status | M | Merged Variants | dgv992e201 | Supporting Variants | essv6930383, essv6918702, essv6808339, essv6677799, essv6677788, essv6841200, essv6849032, essv6949817, essv6959995, essv6764947, essv6947262, essv6837362, essv6837372, essv6808336, essv6911276, essv6896726, essv6764955, essv6963633, essv6934643, essv6893462, essv6676478, essv6884161, essv6893458, essv6794593, essv6711772, essv6896728, essv6748686, essv6884163, essv6727987, essv6915016, essv6715449, essv6887544, essv6798769, essv6798768, essv6697877, essv6794476, essv6818148, essv6728198, essv6790446, essv6830119, essv6677744, essv6837369, essv6727998, essv6844855, essv6808334, essv6818151, essv6764948, essv6943304, essv6687189, essv6715446, essv6770730, essv6915012, essv6911270, essv6903681, essv6708361, essv6855144, essv6739934, essv6759943, essv6869637, essv6736922, essv6943294, essv6677899, essv6798772, essv6841196, essv6730812, essv6841192, essv6822396, essv6736917, essv6676480, essv6886962, essv6849035, essv6677722, essv6872663, essv6697882, essv6770734, essv6751547, essv6956916, essv6841188, essv6727055, essv6943307, essv6865524, essv6727965, essv6947733, essv6794554, essv6841199, essv6743091, essv6938921, essv6951813, essv6854943, essv6818155, essv6849039, essv6730826, essv6943312, essv6841204, essv6754471, essv6911283, essv6855143, essv6811244, essv6730825, essv6790450, essv6743101, essv6969291, essv6890162, essv6890159, essv6700992, essv6893451, essv6969294, essv6762581, essv6875646, essv6844856, essv6960006, essv6907470, essv6878563, essv6860755, essv6805356, essv6677733, essv6822394, essv6927573, essv6770747, essv6830121, essv6887522, essv6922999, essv6918699, essv6907478, essv6778117, essv6790445, essv6759978, essv6946818, essv6875643, essv6700996, essv6687194, essv6794443, essv6728065, essv6869635, essv6918692, essv6956910, essv6943308, essv6849041, essv6671037, essv6825432, essv6949706, essv6728131, essv6911294, essv6837373, essv6687190, essv6818156, essv6844851, essv6974687, essv6794388, essv6770749, essv6727976, essv6794510, essv6774552, essv6728020, essv6869628, essv6903680, essv6734302, essv6893468, essv6715440, essv6782120, essv6790458, essv6959951, essv6927596, essv6890157, essv6734304, essv6903671, essv6782128, essv6736925, essv6879820, essv6790441, essv6878560, essv6715456, essv6837380, essv6719344, essv6811246, essv6927562, essv6903668, essv6802523, essv6822395, essv6700995, essv6690360, essv6911281, essv6899625, essv6878562, essv6757358, essv6703243, essv6687191, essv6805353, essv6690366, essv6759987, essv6907472, essv6683949, essv6774554, essv6837383, essv6948817, essv6743097, essv6890160, essv6805355, essv6880597, essv6963631, essv6764949, essv6762572, essv6911293, essv6671039, essv6926726, essv6884156, essv6798770, essv6808333, essv6790459, essv6826324, essv6959973, essv6911273, essv6711770, essv6918693, essv6730813, essv6715438, essv6887511, essv6770729, essv6671038, essv6854932, essv6680333, essv6951814, essv6948706, essv6869634, essv6690363, essv6911259, essv6790460, essv6926724, essv6677844, essv6826319, essv6667513, essv6762573, essv6715439, essv6947929, essv6849050, essv6833704, essv6757356, essv6887566, essv6860757, essv6844852, essv6930384, essv6951819, essv6794499, essv6694100, essv6770741, essv6743096, essv6943311, essv6893456, essv6855148, essv6825543, essv6884160, essv6794521, essv6782123, essv6802519, essv6926723, essv6890158, essv6930386, essv6736919, essv6911277, essv6680330, essv6869639, essv6960040, essv6770737, essv6715453, essv6708355, essv6951821, essv6943291, essv6833705, essv6694097, essv6878565, essv6754470, essv6730815, essv6715447, essv6907477, essv6849045, essv6893448, essv6869629, essv6728076, essv6865520, essv6875645, essv6730827, essv6802520, essv6762585, essv6734303, essv6837374, essv6743090, essv6860750, essv6798771, essv6786326, essv6947151, essv6963638, essv6748684, essv6762583, essv6849051, essv6762582, essv6849037, essv6770739, essv6884162, essv6899627, essv6818159, essv6770732, essv6890152, essv6711775, essv6711779, essv6676481, essv6833707, essv6922998, essv6687192, essv6711771, essv6869627, essv6878570, essv6683945, essv6911290, essv6948928, essv6947741, essv6934644, essv6844858, essv6837368, essv6687188, essv6767463, essv6830126, essv6878568, essv6739929, essv6759977, essv6770736, essv6786324, essv6918700, essv6934642, essv6899628, essv6886966, essv6711773, essv6730824, essv6869640, essv6745904, essv6865519, essv6739933, essv6811242, essv6830122, essv6748682, essv6872667, essv6943298, essv6844845, essv6825532, essv6790451, essv6774555, essv6837363, essv6893467, essv6680328, essv6708360, essv6676479, essv6903675, essv6703288, essv6923000, essv6918691, essv6680334, essv6956913, essv6802526, essv6730814, essv6711785, essv6830123, essv6884157, essv6849038, essv6860745, essv6918680, essv6860748, essv6855141, essv6751545, essv6727057, essv6711777, essv6943293, essv6872662, essv6880708, essv6833703, essv6790444, essv6757357, essv6736916, essv6727053, essv6687195, essv6704930, essv6869633, essv6697883, essv6878569, essv6825521, essv6974691, essv6927662, essv6782126, essv6918686, essv6762580, essv6849034, essv6896731, essv6704927, essv6943305, essv6849040, essv6770757, essv6745902, essv6808337, essv6918683, essv6923001, essv6770733, essv6943302, essv6770735, essv6811253, essv6893469, essv6841194, essv6770728, essv6918713, essv6767462, essv6890156, essv6811248, essv6918694, essv6893466, essv6915013, essv6708356, essv6690367, essv6974686, essv6911296, essv6694095, essv6751544, essv6837370, essv6739928, essv6880042, essv6680337, essv6723167, essv6743094, essv6899631, essv6886965, essv6739927, essv6676482, essv6782122, essv6887533, essv6865522, essv6794596, essv6837378, essv6860747, essv6951822, essv6764959, essv6723164, essv6697880, essv6911266, essv6915014, essv6893447, essv6774556, essv6786325, essv6770738, essv6911260, essv6711780, essv6938916, essv6899629, essv6708367, essv6943300, essv6814255, essv6770743, essv6865523, essv6770740, essv6947484, essv6951820, essv6728154, essv6956919, essv6875640, essv6854954, essv6927607, essv6879486, essv6872665, essv6837367, essv6837366, essv6943290, essv6794594, essv6927618, essv6849036, essv6938925, essv6849033, essv6844842, essv6700993, essv6704925, essv6736915, essv6697879, essv6837371, essv6881350, essv6880264, essv6884158, essv6743095, essv6969293, essv6946929, essv6896727, essv6943313, essv6728054, essv6903667, essv6969292, essv6687196, essv6893452, essv6890163, essv6893453, essv6837379, essv6690361, essv6890161, essv6938926, essv6759920, essv6790442, essv6697875, essv6782127, essv6943301, essv6841185, essv6893463, essv6960073, essv6811249, essv6837365, essv6956911, essv6759932, essv6911274, essv6887555, essv6739930, essv6896729, essv6956917, essv6730810, essv6951812, essv6899630, essv6886961, essv6878566, essv6956912, essv6855147, essv6715458, essv6974688, essv6881153, essv6911265, essv6869641, essv6786323, essv6947734, essv6770744, essv6794399, essv6767458, essv6926727, essv6844859, essv6896733, essv6844861, essv6911272, essv6811247, essv6697881, essv6844848, essv6896744, essv6893464, essv6802522, essv6703232, essv6943297, essv6727059, essv6708358, essv6890151, essv6948151, essv6943303, essv6730822, essv6802528, essv6743093, essv6704929, essv6751546, essv6963630, essv6911291, essv6751543, essv6794465, essv6762589, essv6728087, essv6762584, essv6860756, essv6841184, essv6938920, essv6754472, essv6802527, essv6880153, essv6879597, essv6811250, essv6728009, essv6767459, essv6948373, essv6808335, essv6680335, essv6943309, essv6963636, essv6890153, essv6778118, essv6770759, essv6865526, essv6811241, essv6676483, essv6826318, essv6947739, essv6770745, essv6959962, essv6734306, essv6938919, essv6860754, essv6715441, essv6918703, essv6844847, essv6715448, essv6915015, essv6911268, essv6708366, essv6723165, essv6786322, essv6818149, essv6694096, essv6956914, essv6736921, essv6680329, essv6974694, essv6943310, essv6860749, essv6948262, essv6814253, essv6754473, essv6728142, essv6881354, essv6778119, essv6715442, essv6743092, essv6700994, essv6869632, essv6881264, essv6878571, essv6911267, essv6881375, essv6825454, essv6808340, essv6708357, essv6734305, essv6687193, essv6896725, essv6963639, essv6794543, essv6794421, essv6869630, essv6974692, essv6899624, essv6948040, essv6844849, essv6754474, essv6727060, essv6855149, essv6974689, essv6963635, essv6794532, essv6963632, essv6926725, essv6841197, essv6947040, essv6833708, essv6893450, essv6899626, essv6794454, essv6683947, essv6841186, essv6736923, essv6677910, essv6770756, essv6841193, essv6764951, essv6708362, essv6875644, essv6855146, essv6680331, essv6918685, essv6822397, essv6918681, essv6818150, essv6844850, essv6943292, essv6918688, essv6759980, essv6893455, essv6860751, essv6764950, essv6762587, essv6844844, essv6759954, essv6719341, essv6730816, essv6844860, essv6704924, essv6677766, essv6844841, essv6893446, essv6770748, essv6730818, essv6938918, essv6677755, essv6918701, essv6946706, essv6667514, essv6969290, essv6700997, essv6893445, essv6748683, essv6893457, essv6762574, essv6704933, essv6869626, essv6715455, essv6918682, essv6745900, essv6896730, essv6734308, essv6719343, essv6911271, essv6860758, essv6727056, essv6794592, essv6943296, essv6748685, essv6794410, essv6903672, essv6896742, essv6844840, essv6697878, essv6911295, essv6903670, essv6730811, essv6903666, essv6759976, essv6879709, essv6963634, essv6730809, essv6878572, essv6690362, essv6837381, essv6743098, essv6786327, essv6855145, essv6959984, essv6878561, essv6974690, essv6886963, essv6881348, essv6943299, essv6860746, essv6683946, essv6730817, essv6927629, essv6869638, essv6745901, essv6711774, essv6790452, essv6974697, essv6893449, essv6764954, essv6767460, essv6881347, essv6782124 | Samples | SSM100, SSM059, SSM036, SSM008, SSM083, SSM071, SSM027, SSM024, SSM075, SSM045, SSM046, SSM011, SSM064, SSM079, SSM065, SSM087, SSM038, SSM097, SSM039, SSM013, SSM009, SSM073, SSM093, SSM050, SSM074, SSM042, SSM088, SSM002, SSM041, SSM057, SSM023, SSM058, SSM028, SSM092, SSM084, SSM090, SSM021, SSM047, SSM018, SSM069, SSM061, SSM029, SSM096, SSM062, SSM026, SSM089, SSM017, SSM019, SSM035, SSM094, SSM032, SSM003, SSM031, SSM067, SSM044, SSM001, SSM014, SSM086, SSM033, SSM066, SSM006, SSM085, SSM068, SSM081, SSM040, SSM072, SSM082, SSM020, SSM007, SSM015, SSM078, SSM016, SSM053, SSM005, SSM080, SSM037, SSM077, SSM076, SSM022, SSM010, SSM091, SSM055, SSM070, SSM095, SSM025, SSM034, SSM004, SSM099, SSM043, SSM052, SSM098, SSM049, SSM056, SSM030, SSM063, SSM012 | Known Genes | HCG4, HCG4B, HLA-A, HLA-F, HLA-F-AS1, HLA-G, HLA-H, IFITM4P, LOC554223 | Method | Sequencing | Analysis | Breakdancer:4 times standard deviation,VariationHunter:4 times standard deviation and at least 3 supportting reads | Platform | Illumina HiSeq 2000 | Comments | | Reference | Wong_et_al_2012b | Pubmed ID | 23290073 | Accession Number(s) | esv2731767
| Frequency | Sample Size | 96 | Observed Gain | 0 | Observed Loss | 96 | Observed Complex | 0 | Frequency | n/a |
|
|