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Variant Details

Variant: esv2730995



Internal ID9965312
Landmark
Location Information
TypeCoordinatesAssemblyOther Links
Outerchr10:2770220..3706473hg38UCSC Ensembl
Outerchr10:2812412..3748665hg19UCSC Ensembl
Cytoband10p15.2
Allele length
AssemblyAllele length
hg38936254
hg19936254
Variant TypeCNV deletion
Copy Number
Allele State
Allele Origin
Probe Count
Validation Flag
Merged StatusM
Merged Variants
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Known GenesPFKP, PITRM1, PITRM1-AS1
MethodSequencing
AnalysisBreakdancer:4 times standard deviation,VariationHunter:4 times standard deviation and at least 3 supportting reads
PlatformIllumina HiSeq 2000
Comments
ReferenceWong_et_al_2012b
Pubmed ID23290073
Accession Number(s)esv2730995
Frequency
Sample Size96
Observed Gain0
Observed Loss90
Observed Complex0
Frequencyn/a


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