Variant DetailsVariant: esv2726477 | Internal ID | 10310113 | | Landmark | | | Location Information | | | Cytoband | 3q29 | | Allele length | | Assembly | Allele length | | hg38 | 110975 | | hg19 | 110975 |
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| | Frequency | | Sample Size | 96 | | Observed Gain | 0 | | Observed Loss | 93 | | Observed Complex | 0 | | Frequency | n/a |
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