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Variant Details

Variant: esv2718594



Internal ID9952886
Landmark
Location Information
TypeCoordinatesAssemblyOther Links
Outerchr19:42788322..43286118hg38UCSC Ensembl
Outerchr19:43292474..43790270hg19UCSC Ensembl
Cytoband19q13.2
Allele length
AssemblyAllele length
hg38497797
hg19497797
Variant TypeCNV deletion
Copy Number
Allele State
Allele Origin
Probe Count
Validation Flag
Merged StatusM
Merged Variantsdgv523e201
Supporting Variantsessv6914874, essv6812975, essv6741922, essv6874466, essv6921386, essv6696725, essv6781821, essv6721701, essv6913706, essv6858795, essv6843563, essv6921381, essv6921390, essv6877459, essv6717871, essv6898403, essv6898400, essv6682582, essv6925380, essv6816337, essv6753325, essv6710355, essv6674826, essv6810160, essv6713962, essv6812972, essv6883077, essv6689080, essv6950210, essv6707047, essv6967514, essv6902268, essv6828745, essv6917150, essv6764031, essv6729347, essv6780522, essv6909805, essv6914863, essv6905860, essv6692475, essv6898401, essv6750410, essv6801335, essv6694232, essv6835891, essv6874465, essv6773159, essv6832311, essv6707052, essv6780523, essv6696723, essv6917154, essv6880245, essv6696726, essv6717867, essv6717253, essv6717873, essv6717276, essv6868439, essv6797140, essv6666494, essv6909809, essv6946157, essv6921394, essv6667066, essv6863636, essv6758888, essv6868440, essv6921387, essv6725529, essv6868441, essv6784678, essv6707051, essv6961034, essv6917155, essv6725535, essv6937355, essv6871506, essv6814632, essv6667077, essv6692474, essv6937356, essv6733200, essv6925384, essv6766366, essv6721703, essv6707050, essv6917158, essv6874575, essv6758886, essv6971958, essv6792951, essv6925383, essv6947906, essv6928807, essv6950209, essv6885789, essv6901409, essv6852824, essv6692480, essv6729344, essv6888806, essv6843564, essv6725531, essv6804228, essv6717872, essv6928809, essv6828742, essv6814643, essv6744742, essv6914896, essv6807167, essv6892106, essv6852827, essv6832312, essv6921391, essv6674824, essv6773156, essv6871505, essv6773160, essv6967513, essv6667032, essv6689081, essv6858796, essv6784677, essv6921389, essv6846745, essv6729346, essv6863634, essv6954388, essv6667099, essv6917156, essv6883079, essv6783931, essv6707046, essv6905861, essv6738642, essv6950211, essv6871508, essv6804230, essv6692473, essv6807168, essv6784673, essv6781798, essv6883080, essv6843560, essv6741921, essv6839680, essv6954389, essv6788846, essv6885790, essv6858799, essv6917153, essv6824680, essv6895589, essv6914885, essv6792957, essv6710353, essv6898399, essv6921382, essv6839677, essv6717864, essv6967511, essv6961033, essv6746353, essv6674823, essv6871507, essv6946161, essv6733198, essv6828744, essv6773157, essv6874586, essv6804229, essv6816338, essv6741920, essv6928808, essv6921384, essv6858794, essv6725533, essv6744741, essv6810162, essv6725528, essv6667088, essv6761684, essv6764029, essv6921383, essv6682580, essv6971959, essv6892108, essv6703570, essv6841943, essv6874467, essv6713964, essv6852826, essv6901412, essv6810161, essv6846752, essv6756355, essv6874470, essv6846747, essv6839681, essv6792955, essv6792958, essv6824681, essv6746364, essv6874472, essv6921388, essv6667132, essv6941460, essv6843558, essv6858797, essv6667121, essv6880244, essv6792952, essv6667143, essv6717869, essv6792956, essv6824679, essv6925386, essv6707049, essv6682581, essv6741918, essv6744744, essv6717860, essv6699414, essv6928811, essv6788845, essv6874469, essv6810158, essv6797144, essv6814654, essv6810159, essv6877458, essv6895586, essv6812973, essv6917149, essv6961032, essv6895588, essv6750408, essv6788843, essv6674825, essv6781832, essv6717866, essv6746342, essv6913709, essv6868435, essv6801337, essv6733197, essv6909804, essv6846748, essv6780524, essv6773158, essv6717870, essv6812974, essv6781787, essv6892107, essv6846753, essv6846749, essv6810157, essv6668742, essv6921393, essv6846746, essv6868438, essv6925382, essv6753321, essv6707048, essv6692478, essv6843559, essv6810163, essv6667110, essv6917147, essv6692477, essv6877460, essv6883075, essv6843561, essv6807169, essv6678885, essv6692479, essv6971960, essv6898402, essv6846744, essv6921392, essv6797141, essv6901411, essv6888807, essv6832309, essv6863637, essv6839679, essv6769292, essv6694254, essv6717231, essv6696727, essv6769293, essv6941461, essv6846750, essv6773155, essv6868437, essv6738644, essv6843562, essv6696724, essv6852825, essv6717868, essv6703574, essv6863633, essv6947917, essv6839678, essv6816340, essv6761683, essv6753324, essv6717242, essv6925381, essv6694243, essv6735833, essv6784675, essv6954386, essv6792950, essv6784042, essv6721702, essv6781809, essv6729345, essv6717861, essv6703575, essv6954387, essv6901413, essv6868436, essv6814621, essv6905862, essv6888805, essv6902266, essv6883078, essv6788847, essv6946160, essv6797143, essv6725534, essv6667044, essv6967512, essv6932981, essv6874468, essv6703573, essv6703572, essv6846751, essv6841932, essv6863635, essv6756356, essv6753322, essv6725527, essv6756354, essv6753319, essv6852828, essv6758884, essv6769291, essv6753323, essv6733196, essv6901414, essv6717265, essv6967515, essv6946162, essv6877457, essv6816339, essv6928810, essv6909808, essv6917157, essv6874598, essv6874471, essv6877461, essv6801336, essv6814610, essv6703571, essv6971961, essv6947895, essv6928812, essv6946159
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Known GenesLOC100289650, LOC284344, PSG1, PSG10P, PSG11, PSG2, PSG4, PSG5, PSG6, PSG7, PSG9
MethodSequencing
AnalysisBreakdancer:4 times standard deviation,VariationHunter:4 times standard deviation and at least 3 supportting reads
PlatformIllumina HiSeq 2000
Comments
ReferenceWong_et_al_2012b
Pubmed ID23290073
Accession Number(s)esv2718594
Frequency
Sample Size96
Observed Gain0
Observed Loss92
Observed Complex0
Frequencyn/a


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