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Variant Details

Variant: esv2718342



Internal ID9952633
Landmark
Location Information
TypeCoordinatesAssemblyOther Links
Outerchr19:21595468..22933994hg38UCSC Ensembl
Outerchr19:21778270..23116796hg19UCSC Ensembl
Cytoband19p12
Allele length
AssemblyAllele length
hg381338527
hg191338527
Variant TypeCNV deletion
Copy Number
Allele State
Allele Origin
Probe Count
Validation Flag
Merged StatusM
Merged Variantsdgv511e201
Supporting Variantsessv6913669, essv6950175, essv6828713, essv6895562, essv6744717, essv6666622, essv6769256, essv6947584, essv6902230, essv6914630, essv6699396, essv6880212, essv6909777, essv6824642, essv6674779, essv6685914, essv6747561, essv6932941, essv6713940, essv6828715, essv6883058, essv6766344, essv6960988, essv6852784, essv6946113, essv6885762, essv6925349, essv6746031, essv6901379, essv6801307, essv6913670, essv6863591, essv6839651, essv6937316, essv6666644, essv6713941, essv6880213, essv6932945, essv6750380, essv6721672, essv6735810, essv6761657, essv6729317, essv6788811, essv6780490, essv6692444, essv6932939, essv6846723, essv6883060, essv6921334, essv6841598, essv6843523, essv6741889, essv6863595, essv6874220, essv6901378, essv6928781, essv6713937, essv6761656, essv6741885, essv6776668, essv6909774, essv6858755, essv6909778, essv6666437, essv6971926, essv6784644, essv6781388, essv6941420, essv6729315, essv6753291, essv6780495, essv6843524, essv6895561, essv6874242, essv6682539, essv6729314, essv6841586, essv6792912, essv6797107, essv6682541, essv6725493, essv6689052, essv6871477, essv6750381, essv6852788, essv6807137, essv6950177, essv6960985, essv6804207, essv6699397, essv6721671, essv6807138, essv6784640, essv6744716, essv6764006, essv6871478, essv6814254, essv6937315, essv6967472, essv6780491, essv6773123, essv6960990, essv6716943, essv6913666, essv6717827, essv6846722, essv6913667, essv6729316, essv6784648, essv6892092, essv6721673, essv6682544, essv6685912, essv6852790, essv6682540, essv6666439, essv6801305, essv6741890, essv6744715, essv6841575, essv6824645, essv6696691, essv6824646, essv6797110, essv6812942, essv6750378, essv6674780, essv6781321, essv6885763, essv6733164, essv6863592, essv6792911, essv6877438, essv6967479, essv6668720, essv6699395, essv6835862, essv6839647, essv6888776, essv6954349, essv6784642, essv6812941, essv6816317, essv6946115, essv6703535, essv6756325, essv6917111, essv6678860, essv6692442, essv6925347, essv6888779, essv6954347, essv6693965, essv6717828, essv6735811, essv6745998, essv6832281, essv6892090, essv6950176, essv6898365, essv6744719, essv6788807, essv6814243, essv6960987, essv6781377, essv6846719, essv6820876, essv6871482, essv6888780, essv6941419, essv6925348, essv6678858, essv6666677, essv6725495, essv6801308, essv6892091, essv6666436, essv6901375, essv6810129, essv6693998, essv6747560, essv6820878, essv6666435, essv6971925, essv6716932, essv6750379, essv6941421, essv6758868, essv6716965, essv6781343, essv6932942, essv6781376, essv6797108, essv6839649, essv6892089, essv6902227, essv6781598, essv6874209, essv6820883, essv6832282, essv6692440, essv6717829, essv6820874, essv6781354, essv6835863, essv6841642, essv6898367, essv6812946, essv6725491, essv6753294, essv6780492, essv6807139, essv6707015, essv6699394, essv6960989, essv6804206, essv6820873, essv6769255, essv6843525, essv6946114, essv6946112, essv6694009, essv6792914, essv6784647, essv6707018, essv6954348, essv6797112, essv6858763, essv6947640, essv6812947, essv6832280, essv6898368, essv6824644, essv6874432, essv6902231, essv6780493, essv6898363, essv6880216, essv6689053, essv6725490, essv6738613, essv6797111, essv6801304, essv6967474, essv6773127, essv6841653, essv6678859, essv6693976, essv6781332, essv6716954, essv6895560, essv6738612, essv6692441, essv6804212, essv6674781, essv6967475, essv6710335, essv6839648, essv6852789, essv6858756, essv6678862, essv6828717, essv6666438, essv6682538, essv6888778, essv6937314, essv6721674, essv6917112, essv6946116, essv6713938, essv6954352, essv6746009, essv6846718, essv6863590, essv6753293, essv6744718, essv6843526, essv6839650, essv6871480, essv6784646, essv6877439, essv6668721, essv6792913, essv6820875, essv6769260, essv6776667, essv6932944, essv6858757, essv6788806, essv6710334, essv6738614, essv6868396, essv6914641, essv6780494, essv6707017, essv6832283, essv6788805, essv6820879, essv6914608, essv6674777, essv6666655, essv6937317, essv6666666, essv6852787, essv6921335, essv6733163, essv6874265, essv6921336, essv6693987, essv6932943, essv6874231, essv6921337, essv6707016, essv6703536, essv6746020, essv6766346, essv6689056, essv6781399, essv6880214, essv6909775, essv6776669, essv6839652, essv6678861, essv6807136, essv6807140, essv6713942, essv6947596, essv6747562, essv6769259, essv6781310, essv6810130, essv6885765, essv6801306, essv6703533, essv6863593, essv6689051, essv6756324, essv6666434, essv6784641, essv6814266, essv6858762, essv6835866, essv6883059, essv6674778, essv6788812, essv6703534, essv6941422, essv6960986, essv6666611, essv6828714, essv6804211, essv6946111, essv6773122, essv6909772, essv6753292, essv6871481, essv6921333, essv6947618, essv6685913, essv6954351, essv6967478, essv6863594, essv6766345, essv6807135, essv6901383, essv6852785
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Known GenesLOC100996349, LOC440518, LOC641367, ZNF100, ZNF208, ZNF257, ZNF43, ZNF492, ZNF676, ZNF729, ZNF98, ZNF99
MethodSequencing
AnalysisBreakdancer:4 times standard deviation,VariationHunter:4 times standard deviation and at least 3 supportting reads
PlatformIllumina HiSeq 2000
Comments
ReferenceWong_et_al_2012b
Pubmed ID23290073
Accession Number(s)esv2718342
Frequency
Sample Size96
Observed Gain0
Observed Loss95
Observed Complex0
Frequencyn/a


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